公司在清退员工时，补偿的具体标准和方式主要依据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规来确定。以下是对此问题的详细解答：

一、合法解除劳动合同的补偿

1. 协商一致解除

   • 当用人单位与劳动者协商一致解除劳动合同时，用人单位需按照劳动者在本单位的工作年限支付经济补偿。具体标准为：每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资。这里的月工资是指劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。

2. 无过失性辞退

   • 在某些特定情况下，如劳动者患病或非因工负伤后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作；或者劳动者不能胜任工作，经过培训或调整工作岗位后仍不能胜任；或者劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，且双方未能就变更劳动合同内容达成协议的，用人单位可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人或额外支付一个月工资后解除劳动合同，并需按照协商一致解除的标准支付经济补偿。

3. 经济性裁员

   • 当用人单位因企业破产重整或生产经营发生严重困难等情形需要裁减人员时，应提前三十日向工会或全体职工说明情况，听取意见后，裁减人员方案经向劳动行政部门报告，可以裁减人员。经济性裁员同样需要按照协商一致解除的标准支付经济补偿。

4. 特殊情况

   • 如果劳动者的月工资高于当地上年度职工月平均工资三倍的，经济补偿金按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。

二、违法解除劳动合同的赔偿

• 如果用人单位违反法律规定解除或终止劳动合同，需按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。即，按劳动者在本单位的工作年限，每满一年支付两个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付一个月工资的赔偿金。

三、其他补偿

1. 未休年假补偿

   • 公司应按照员工未休年假的天数，支付三倍的正常工资作为补偿。

2. 未支付工资及福利

   • 公司应结清员工清算前应得的工资报酬，并补缴社会保险等费用。

四、补偿流程

1. 通知工会

   • 在辞退员工前，公司应事先将理由通知工会，并研究工会的意见。

2. 书面通知员工

   • 公司应向员工发出明确的辞退通知，包括辞退原因、日期、补偿标准等。

3. 办理离职手续

   • 包括工作交接、工资结算、社会保险及住房公积金减员等，同时按约定支付经济补偿金或赔偿金。

总结与建议

公司在清退员工时，必须严格遵守相关法律法规，确保合法合规地处理员工的补偿事宜。无论是合法解除还是违法解除，都应按照规定的标准支付相应的经济补偿金或赔偿金，并妥善处理好员工的未休年假、工资及福利等问题。如果员工对公司的辞退行为或补偿金额有异议，建议通过劳动仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。同时，公司在处理此类事务时，也应注重与员工的沟通，尽量达成双方都能接受的解决方案，以维护公司的良好形象和员工的合法权益。