结论前置：

1. 一般情况下，女方父亲有案底不会直接影响男方孩子的一般民事权利义务。
2. 但在特定情况下，如政治审查、特殊职业资格申请等，可能会存在间接影响，具体程度需根据案底的性质、严重程度及所涉领域的具体要求而定。

详细分析：

1. 一般民事权利义务无直接影响：

   • 从法律层面讲，女方父亲的案底通常不会对男方孩子的一般民事权利义务（如财产继承、教育权利等）产生直接影响。孩子的法律地位和权益是独立的，不受其家庭成员犯罪记录的影响。例如，孩子继承财产的权利不会因为外公的案底而受到影响。

2. 政治审查方面的可能影响：

   • 如果男方孩子将来要报考一些对政治背景要求严格的单位或职位，如参军入伍、报考某些重要岗位的公务员（特别是国安、公安、机要等特殊职位），可能会面临较为严格的政治审查。在这种情况下，女方父亲的案底可能会被作为审查的一部分进行考量。但具体影响程度需根据案底的性质、严重程度以及所报考岗位的具体要求来确定。例如，如果案底涉及危害国家安全等严重犯罪，可能会对孩子的政治审查产生较大影响。

3. 特殊职业资格申请的潜在影响：

   • 在某些特殊职业资格申请中，如涉及高度公共安全、道德审查极为严格的职业（如飞行员、律师等，具体取决于职业要求和审核标准），资格审核过程中可能会调查申请人的家庭背景。虽然这种情况相对较少，但存在因亲属案底而受到一定影响的可能性。例如，如果申请律师职业，虽然主要审查的是申请人本人的道德和法律素养，但家庭成员的犯罪记录也可能在某种程度上影响审核结果。

4. 社会观念与偏见：

   • 除法律层面的影响外，社会观念也是一个不可忽视的因素。在某些社会环境中，人们可能会因家庭成员的犯罪记录而对后代持有某种偏见或看法。这种偏见或看法可能会影响孩子的社交、教育等方面。例如，孩子在学校可能会因为外公的案底而受到其他同学的歧视或排斥。

法律建议：

• 如果您对此类问题有疑问或担忧，建议直接向我咨询，我可以根据您的具体情况提供更针对性的分析和指导。
• 同时，您也可以关注相关领域的具体要求和审核标准，以便更好地了解可能的影响和应对措施。

总结：女方父亲有案底并不一定会对男方孩子产生直接影响，但在某些特定情况和领域可能会存在一定的间接关联或影响。因此，在面对相关问题时，应综合考虑多种因素并寻求专业意见。