针对交通违规罚款1000元扣6分的处理方式，结合法律程序与实务操作，具体处理步骤如下：

1. 确认违法事实与处罚依据
   首先需通过交警部门出具的《公安交通管理简易程序处罚决定书》或《行政处罚决定书》，确认以下信息：

   • 违法行为具体内容（如超速50%以下、闯红灯、不按导向车道行驶等）；
     
   • 处罚依据的法律条款（如《道路交通安全法》第90条、《道路交通安全违法行为记分管理办法》第10条等）；
     
   • 罚款金额（1000元）与记分分值（6分）是否与违法行为匹配。
     若对处罚有异议，需在收到决定书之日起60日内申请行政复议，或6个月内提起行政诉讼。

2. 缴纳罚款的流程与注意事项

   • 缴纳方式：可通过“交管12123”APP、银行柜台、自助终端或交警窗口完成缴纳，需在决定书载明的15日内完成，逾期每日按罚款数额的3%加处罚款（最高不超过本金）。
     
   • 电子支付凭证：保留缴费成功的截图或回执，作为已履行处罚的证明。
     
   • 特殊情形：若因经济困难需延期缴纳，可向作出处罚的交警部门提出申请，经批准后可暂缓或分期缴纳。

3. 记分处理与驾驶证状态

   • 记分周期：6分将记入当前记分周期（初始为12分），若周期内累计记分达到12分，需参加7日交通安全教育并重考科目一；若记分未达12分，周期结束后自动清零。
     
   • 记分影响：6分可能导致保险费率上浮、部分城市限行政策受限（如外地车牌进京需核验记分），或影响网约车、出租车从业资格申请。
     若驾驶证已被扣留，需在15日内参加满分学习，否则可能面临吊销驾驶证的处罚。

4. 后续合规建议

   • 定期查询记分：通过“交管12123”APP实时查看驾驶证状态，避免因未处理违法导致记分累积。
     
   • 安全驾驶培训：若记分频繁，可主动参加交警部门组织的交通安全培训，部分地区对完成培训的驾驶员可减免记分。
     
   • 法律风险防范：若违法行为涉及事故责任，需同步处理民事赔偿或刑事责任（如危险驾驶罪），避免因单一违法引发连锁法律后果。

总结：处理此类处罚需以确认违法事实为前提，及时缴纳罚款避免滞纳金，关注记分对驾驶证的影响，并通过合规行为降低后续风险。若有具体违法行为细节或地方政策疑问，可进一步向我咨询。