结论：信号灯有问题直接变红灯时，是否会被处罚取决于具体情况。一般来说，如果因信号灯故障导致误闯红灯，且能提供充分证据证明非主观故意，通常不会被处罚；但如果无法证明或存在其他违规行为，则可能面临处罚。

详细分析：

1. 信号灯故障导致的误闯红灯：

   • 法律背景：根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，交通信号灯的设置应当符合道路交通安全、畅通的要求和国家标准，并保持清晰、醒目、准确、完好。如果信号灯出现故障，导致驾驶人无法准确判断信号，从而误闯红灯，这并非驾驶人的主观故意。
   • 处理原则：在这种情况下，如果驾驶人能够提供充分的证据（如行车记录仪视频、现场照片等）证明信号灯确实存在故障，并且自己是在无法判断信号的情况下误闯红灯，那么通常不会被交通管理部门处罚。

2. 无法证明信号灯故障或存在其他违规行为：

   • 法律后果：如果驾驶人无法提供充分证据证明信号灯故障，或者虽然信号灯故障但驾驶人存在其他违规行为（如超速、未按规定车道行驶等），那么交通管理部门可能会根据具体情况对驾驶人进行处罚。
   • 处罚依据：处罚将依据《中华人民共和国道路交通安全法》及其相关实施条例中关于闯红灯、超速、未按规定车道行驶等违规行为的处罚规定进行。

3. 建议与措施：

   • 保留证据：如果遇到信号灯故障导致误闯红灯的情况，驾驶人应尽可能保留相关证据，如行车记录仪视频、现场照片等，以便在需要时向交通管理部门证明自己的清白。
   • 及时申诉：如果驾驶人认为自己的误闯红灯是由于信号灯故障导致的，并且已经保留了充分证据，那么可以在收到交通违法处罚通知后，及时向交通管理部门提出申诉，要求撤销处罚。
   • 遵守交通规则：无论信号灯是否正常工作，驾驶人都应严格遵守交通规则，确保行车安全。在遇到信号灯故障时，应减速慢行、观察周围交通情况，并按照交通标志、标线的指示行驶。

总结与提醒：信号灯有问题直接变红灯时，驾驶人应保持冷静、遵守交通规则，并尽可能保留相关证据。如果因信号灯故障导致误闯红灯，且能提供充分证据证明非主观故意，通常不会被处罚；但如果无法证明或存在其他违规行为，则可能面临处罚。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。