关于您提出的“父亲有案底女儿是否可以入团”的问题，这主要涉及到入团时的政治审查环节。虽然您提供的参考信息主要是关于征兵的政治考核，但入团和入伍在政治审查方面有一定的相似性，都是对个人及其家庭成员的政治表现进行审查。

首先，我们需要明确的是，入团时的政治审查主要关注的是申请人本人的政治思想表现、道德品质以及是否遵守国家法律法规等方面。对于家庭成员的情况，虽然也会进行一定的了解，但通常不会因为家庭成员的一般犯罪记录而直接否定申请人的入团资格。

具体到您的情况，如果您的父亲有案底，但这个案底并不涉及危害国家安全、组织或参加非法组织、邪教或黑社会性质组织等严重违法犯罪行为，那么一般情况下，这不会直接影响您女儿的入团申请。入团组织在审查时，更注重的是您女儿本人的表现和态度。

然而，如果家庭成员的犯罪行为确实非常严重，且在社会上造成了恶劣影响，那么入团组织在审查时可能会更加谨慎，并综合考虑多种因素来做出决定。但这种情况相对较少，且最终结论会由入团组织依据有关规定和实际情况综合确定。

因此，我的建议是，您可以让女儿正常提交入团申请，并在申请过程中如实填写家庭成员的情况。同时，鼓励女儿保持良好的政治思想表现，积极参与团组织活动，展现自己的优秀品质和潜力。这样，即使家庭成员有案底，也不会成为阻碍她入团的决定性因素。