针对村里填沟纠纷的处理，结合法律实务经验，我给出以下建议：

1. 明确纠纷性质与法律关系
   首先需判断填沟行为是否涉及土地权属争议（如沟渠属于集体所有还是个人承包）、相邻权纠纷（如填沟影响排水、通行）或侵权责任（如未经许可填埋他人土地）。例如：

   • 若沟渠属于村集体所有，填埋需经村民会议或村委会决议，并符合《土地管理法》关于土地用途的规定；
     
   • 若填沟导致相邻农户农田被淹，可能构成《民法典》第296条规定的“妨害物权”，受害方可要求排除妨碍或赔偿损失。

2. 协商与调解优先
   根据《人民调解法》，可申请村委会或乡镇司法所介入调解，重点解决以下问题：

   • 填沟的必要性（如是否为公共利益需要）；
     
   • 补偿方案（如对受影响农户的青苗补偿、土地恢复费用）；
     
   • 后续管理责任（如填埋后土地用途、维护义务）。
     提示：调解协议可申请司法确认，赋予强制执行力。

3. 行政处理途径
   若涉及土地权属争议，可依据《土地管理法》第14条向乡镇政府或县级自然资源部门申请确权；若填沟行为违反规划（如占用基本农田），可向农业农村局或综合执法局举报。

4. 诉讼救济
   若协商、调解、行政处理均无果，可向法院提起民事诉讼或行政诉讼：

   • 民事诉讼：以侵权人或村委会为被告，主张停止侵害、恢复原状或赔偿损失；
     
   • 行政诉讼：若对行政机关的处理决定不服（如土地确权结果），可在6个月内起诉。
     关键证据：土地权属证明、现场照片、损失评估报告、调解记录等。

5. 特殊情形处理

   • 历史遗留问题：若填沟行为发生在多年前，需结合当时政策（如1982年《国家建设征用土地条例》）判断合法性；
     
   • 生态保护要求：若沟渠属于湿地或水源保护区，填埋可能违反《环境保护法》，需承担行政处罚甚至刑事责任。

行动建议：

1. 立即固定证据（如拍照、录像、证人证言）；
   
2. 联合其他受影响村民共同协商，增强谈判筹码；
   
3. 咨询专业律师起草法律文书（如律师函、起诉状），提高维权效率。
   

如有进一步细节（如填沟主体、土地性质、损失情况），可向我补充说明，我会结合具体案情提供针对性方案。