在只有一个绿灯且该绿灯允许左转弯的情况下直行，通常属于不按交通信号灯指示通行的违法行为，可能会被处以20元以上200元以下罚款，并扣6分，但具体处罚需结合实际情况判断。以下为详细分析：

1. 违法行为认定：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第三十八条，车辆、行人应当按照交通信号通行。在只有一个绿灯且该绿灯明确指示为左转弯信号时，直行车辆违反了交通信号灯的指示，属于违法行为。

2. 处罚依据及标准：

   • 依据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者20元以上200元以下罚款。
   • 同时，根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》第十条第八项，驾驶机动车不按交通信号灯指示通行的，一次记6分。

3. 特殊情况考虑：

   • 信号灯设置合理性：如果信号灯设置存在明显不合理，如绿灯同时指示左转弯和直行，但道路标线或标志未明确区分，导致驾驶人误判，这种情况下，驾驶人可能因非主观故意违法而面临较轻的处罚或免于处罚。但需驾驶人提供充分证据证明信号灯设置存在问题。
   • 现场执法情况：如果现场有交警指挥，且交警的指挥与信号灯指示不一致，驾驶人应按照交警的指挥通行。此时，即使直行违反了信号灯指示，也不会受到处罚。

4. 建议处理方式：

   • 如果收到相关违法通知，驾驶人应首先核对违法事实是否准确，包括违法时间、地点、行为等。
   • 如对处罚有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。

温馨提醒：驾驶人在行驶过程中应严格遵守交通信号灯指示，确保行车安全。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。