车辆商业险在符合保险合同约定的情况下，可以赔付自然灾害造成的损失。具体分析如下：

1. 车辆损失险的赔付范围
   根据《中国保险行业协会机动车商业保险示范条款（2020版）》第六条，车辆损失险明确将“雷击、暴风、暴雨、洪水、龙卷风、冰雹、台风、热带风暴、地陷、崖崩、滑坡、泥石流、雪崩、冰陷、暴雪、冰凌、沙尘暴、地震及其次生灾害”等自然灾害纳入保险责任范围。若车辆因上述灾害导致直接损失（如车身损坏、全损），保险公司需按合同约定赔付。

2. 免责条款的例外情形
   需注意以下免责情形：

   • 地震次生灾害的界定：部分保险公司可能将地震单独列为免责项，或对次生灾害（如海啸、火灾）的赔付设置限制，需以具体合同条款为准。
     
   • 未及时通知或施救：若被保险人未在事故发生后48小时内通知保险公司，或未采取合理措施防止损失扩大，保险公司可能部分拒赔。
     
   • 车辆使用性质变更：如车辆从家庭自用改为营运，未通知保险公司变更保险类型的，可能影响赔付。

3. 其他险种的补充作用

   • 发动机涉水险：若车辆因暴雨导致发动机进水损坏，需单独投保涉水险方可赔付（2020版车险改革后，涉水险已并入车损险，但需确认合同是否包含该条款）。
     
   • 玻璃单独破碎险：若仅车窗玻璃因自然灾害损坏，需确认车损险是否覆盖玻璃单独破碎（2020版后通常已包含）。
     
   • 第三者责任险：若自然灾害导致车辆失控撞坏他人财产，需通过第三者责任险赔付，但自然灾害本身不直接触发该险种。

建议行动：

1. 立即联系保险公司报案，保留现场照片、视频等证据；
   
2. 核对保险合同中的“保险责任”和“免责条款”章节；
   
3. 若对赔付范围有争议，可要求保险公司出具书面拒赔通知，并依据《保险法》第二十三条主张权利。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体条款解读或理赔流程。