被告变造证据属于严重的违法行为，会面临严厉的法律后果，具体处理方式如下：

1. 法院的处罚措施：

   • 罚款与拘留：根据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百一十四条，诉讼参与人或其他人伪造、毁灭重要证据，妨碍人民法院审理案件的，法院可根据情节轻重予以罚款、拘留；构成犯罪的，依法追究刑事责任。罚款金额为个人十万元以下、单位五万元以上一百万元以下；拘留期限为十五日以下。
   • 证据效力否定：变造的证据会被法院认定为无效，无法作为认定案件事实的依据。若变造行为导致关键事实无法查清，被告可能承担举证不能的不利后果。

2. 刑事责任追究：

   • 帮助毁灭、伪造证据罪：若被告变造证据行为情节严重（如导致案件错判、引发重大社会影响等），可能触犯《中华人民共和国刑法》第三百零七条第二款，面临三年以下有期徒刑或者拘役的刑事处罚。
   • 其他关联犯罪：若变造证据行为涉及其他犯罪（如诈骗、贪污等），将按重罪处罚或数罪并罚。

3. 对民事诉讼的影响：

   • 推定对方主张成立：根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第九十五条，一方当事人控制证据无正当理由拒不提交，或变造证据导致对方主张难以查证的，法院可推定对方主张成立。
   • 影响法官自由心证：变造行为会严重损害被告的诉讼诚信，法官可能对其其他证据的证明力持审慎态度，甚至直接否定其主张。

建议：若您发现被告变造证据，应立即向法院提交书面异议，说明证据变造的具体情况及依据，并申请法院启动鉴定程序或依职权调查。同时，注意固定相关线索（如证据原件的保管记录、变造痕迹的对比等），为后续处罚或刑事控告提供依据。如有具体案件细节需要分析，可直接向我咨询。