房屋代持协议过户是否多花钱，这主要取决于过户的具体情况以及双方在代持协议中的约定，不能一概而论。以下从几个方面进行详细分析：
一、过户费用构成
房屋过户通常涉及多种费用，包括但不限于契税、个人所得税、增值税及附加、印花税、登记费等。这些费用的具体数额会根据房屋的面积、成交价格、购房年限以及当地政策等因素有所不同。
契税：根据房屋面积和购房次数，契税的税率会有所差异。一般来说，首套房且面积在90平方米以下的，契税税率为1%；面积在90平方米以上的，契税税率为1.5%或更高。二套房的契税税率则可能更高。
个人所得税：如果房屋持有时间不满一定年限（如5年），出售时可能需要缴纳个人所得税。个人所得税的税率通常为房屋增值部分的20%，但也有一些地区有特定的优惠政策。
增值税及附加：对于非普通住宅（如面积较大、价格较高的房屋），如果持有时间不满一定年限，出售时可能需要缴纳增值税及附加。增值税的税率通常为5.6%（含附加税）。
印花税：房屋过户时，买卖双方通常需要缴纳印花税，税率较低。
登记费：房屋过户还需要缴纳一定的登记费，用于办理过户手续。
二、代持协议对过户费用的影响
房屋代持协议是实际购房人与名义购房人之间就房屋所有权归属及代持事宜达成的协议。在代持协议中，双方可以约定过户时的费用承担方式。
约定由实际购房人承担：如果代持协议中明确约定过户费用由实际购房人承担，那么名义购房人在过户时就不需要额外支付费用。但需要注意的是，这种约定只是双方之间的内部约定，不能对抗外部债权人或税务机关。
约定由名义购房人承担：如果代持协议中约定过户费用由名义购房人承担，那么名义购房人在过户时就需要支付相应的费用。但这种情况下，名义购房人可能会要求实际购房人提供一定的补偿或担保。
未约定或约定不明：如果代持协议中没有明确约定过户费用的承担方式，或者约定不明，那么双方可能会因此产生纠纷。在这种情况下，通常需要根据实际情况和公平原则来判断费用的承担方式。
三、实际操作中的建议
明确约定过户费用：在签订房屋代持协议时，双方应明确约定过户费用的承担方式，以避免后续纠纷。
了解当地政策：由于房屋过户费用受当地政策影响较大，因此在过户前，双方应了解当地的具体政策，以便准确计算过户费用。
咨询专业人士：如果双方对过户费用有疑问或争议，可以咨询专业的律师或税务师，以获取更准确的法律意见和税务建议。
总结来说，房屋代持协议过户是否多花钱，取决于过户的具体情况以及双方在代持协议中的约定。在签订代持协议时，双方应明确约定过户费用的承担方式，并在过户前了解当地政策，以避免后续纠纷。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。