房贷逾期后，将款项打入银行卡内，银行是否会扣款，这主要取决于银行的具体操作流程以及贷款合同中的相关约定，但通常情况下，银行是会进行扣款的。以下从几个方面进行详细分析：

1. 银行自动扣款机制：

   • 在房贷还款过程中，银行通常会设置自动扣款机制。这意味着，到了还款日，银行会自动从借款人指定的银行卡中扣除相应的还款金额。
   • 如果借款人逾期未还款，但随后将款项打入银行卡内，且该银行卡仍为贷款还款的指定账户，那么银行在检测到账户内有足够资金时，很可能会按照贷款合同的约定进行自动扣款，以补缴逾期的房贷。

2. 贷款合同约定：

   • 贷款合同中通常会明确约定还款方式、还款时间以及逾期还款的处理方式。
   • 如果合同中规定了银行在逾期后有权从借款人账户中扣款以补缴逾期贷款，那么银行在借款人将款项打入银行卡后，是有权进行扣款的。

3. 实际操作中的可能性：

   • 在实际操作中，银行可能会根据逾期时间的长短、借款人的信用状况以及银行内部的风险控制政策等因素，来决定是否立即进行扣款。
   • 如果逾期时间较短，且借款人之前信用记录良好，银行可能会给予一定的宽限期，或者通过电话、短信等方式提醒借款人尽快还款，而不是立即进行扣款。但一旦借款人将款项打入银行卡，且银行检测到账户内有足够资金，银行很可能会进行扣款。

4. 法律后果与建议：

   • 如果借款人逾期未还款，银行有权按照贷款合同的约定采取一系列措施，包括但不限于收取逾期利息、罚息、违约金等，甚至可能通过法律途径追讨贷款。
   • 因此，建议借款人在房贷逾期后，尽快与银行沟通并了解具体的还款要求和流程。如果确实无法按时还款，可以尝试与银行协商延期还款、分期还款等方案，以避免产生不必要的法律纠纷和经济损失。

总结来说，房贷逾期后将款项打入银行卡内，银行在大多数情况下是会进行扣款的。但具体是否扣款以及扣款的时间、金额等，还需根据贷款合同的约定以及银行的实际操作流程来确定。如果借款人对此有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。