关于土地纠纷时效的计算，这主要取决于纠纷的具体类型以及所适用的法律法规。一般来说，土地纠纷可以分为土地承包合同纠纷和土地违法行为纠纷两大类，它们的时效计算方式有所不同。
一、土地承包合同纠纷的诉讼时效
对于土地承包合同纠纷，我们主要依据《中华人民共和国民法典》的相关规定来确定诉讼时效。
基本诉讼时效期间：
- 土地承包合同纠纷的一般诉讼时效期间为三年。这意味着，自权利人知道或者应当知道其权利受到损害之日起三年内，必须向人民法院提起诉讼以保护自己的民事权利。
诉讼时效起算点：
- 如果是违约纠纷，诉讼时效从一方知道或应当知道对方违约之日起计算。例如，合同约定每年1月1日支付承包费，若承包方未支付，则发包方在1月2日知晓自己权利受损，诉讼时效即从1月2日起算。
- 如果是侵权纠纷，诉讼时效从土地承包经营权人知道或应当知道其土地被非法占用之日起计算。
诉讼时效的特殊情况：
- 最长保护期限：自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。
- 诉讼时效的中止：在诉讼时效期间的最后六个月内，若因不可抗力等法定障碍导致无法行使请求权，诉讼时效中止。障碍消除后满六个月，诉讼时效期间届满。
- 诉讼时效的中断：权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或申请仲裁等情形，可导致诉讼时效中断，并从中断时起重新计算。
合同约定的诉讼时效：
- 如果土地承包合同中明确规定了更长的诉讼时效期间，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么应按照合同约定的时效期间来执行。
二、土地违法行为的追诉时效
对于土地违法行为纠纷，我们主要依据《行政处罚法》中关于违法行为追究时效的规定，并结合土地管理相关法律法规进行具体适用。
基本规定：
- 根据《行政处罚法》第三十六条，违法行为在二年内未被发现的，原则上不再给予行政处罚；涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。法律另有规定的除外。
土地违法行为的追诉时效计算：
- 一般情形：土地违法行为在二年内未被发现的，原则上不再给予行政处罚。这里的“发现”是指行政机关通过日常巡查、举报、媒体曝光等途径知悉或应当知悉违法行为的存在。
- 特殊情形（连续或继续状态）：如果土地违法行为存在连续或者继续状态，如非法占地持续多年、未经批准持续进行土地开发等，追诉时效应从行为终了之日起计算。
实际案例说明：
- 假设某企业在2018年未经批准擅自占用农用地进行建设，且该违法行为一直持续到2023年才被发现。在此情况下，由于违法行为存在连续状态，追诉时效应从行为终了之日（即2023年）起计算。因此，如果该违法行为在2025年之前被发现并处理，则仍在追诉时效内，可以依法给予行政处罚。
三、综合建议
在处理土地纠纷时效问题时，建议您：
- 明确纠纷类型：首先确定纠纷是土地承包合同纠纷还是土地违法行为纠纷，以便选择适用的法律法规。
- 及时咨询专业法律人士：由于土地纠纷时效问题涉及多个法律知识点和实际应用场景，建议您咨询专业法律人士以获取准确的法律意见和帮助。
- 保留相关证据：在纠纷发生过程中，注意保留相关证据，如合同、支付凭证、现场照片等，以便在诉讼或行政处罚过程中证明自己的权益。
希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时咨询。