核心结论：公司运营的电站被农户拆除，公司可依据不同情况采取协商、行政投诉、民事诉讼或刑事报案等措施来维护自身合法权益。以下是具体分析：
一、明确事件性质与责任归属
农户行为合法性审查：
- 首先需确认农户拆除电站的行为是否具有合法依据，如是否基于政府征收决定、环保整改要求等合法行政行为，或是否存在误解、误操作等情形。
- 若农户行为无合法依据，则可能构成侵权或违法行为，公司有权要求其承担相应责任。
公司权益受损情况评估：
- 评估电站被拆除对公司造成的直接经济损失（如设备损坏、停产损失等）和间接经济损失（如商誉损害、市场份额减少等）。
- 收集相关证据，如现场照片、视频、损失清单、合同文件等，以支持后续维权行动。
二、采取具体维权措施
协商解决：
- 尝试与农户进行友好协商，了解其拆除电站的原因和诉求，寻求双方都能接受的解决方案，如赔偿、恢复原状等。
- 协商过程中，可邀请当地村委会、政府相关部门或第三方调解机构参与，以增加协商的成功率和公正性。
行政投诉：
- 若协商无果，且农户行为涉嫌违反相关法律法规（如《治安管理处罚法》、《土地管理法》等），公司可向当地公安机关、土地管理部门或环保部门等行政机关进行投诉。
- 提交投诉时，需提供详细的事件经过、证据材料和诉求，要求行政机关依法调查处理。
民事诉讼：
- 若农户行为构成侵权，公司可向人民法院提起民事诉讼，要求农户承担侵权责任，包括赔偿损失、恢复原状等。
- 诉讼过程中，需准备充分的证据材料，如侵权行为证明、损失评估报告等，以支持公司的诉讼请求。
刑事报案：
- 若农户行为涉嫌构成犯罪（如故意毁坏财物罪、破坏生产经营罪等），公司可向公安机关报案，要求追究农户的刑事责任。
- 报案时，需提供详细的犯罪事实和证据材料，配合公安机关的调查工作。
三、后续预防与应对措施
加强电站安全管理：
- 增加电站周边的安全防护措施，如安装监控摄像头、设置警示标志等，防止类似事件再次发生。
- 定期对电站进行安全检查和维护，确保设备正常运行和人员安全。
完善合同与协议：
- 在与农户签订土地租赁、合作协议等合同时，明确双方的权利和义务，特别是关于电站保护、违约责任等条款。
- 定期对合同进行审查和更新，确保合同内容符合法律法规和实际情况。
建立应急响应机制：
- 制定电站被破坏等突发事件的应急预案，明确应急响应流程和责任人。
- 定期组织应急演练和培训，提高员工应对突发事件的能力和水平。