公司微信转账发工资在遵守相关法律法规的前提下是合法的，但需注意操作规范和潜在风险。以下从多个角度为你详细分析：

合法性依据

1. 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，并未明确禁止电子支付方式。微信转账作为电子支付手段的一种，并不违反该规定。
2. 《工资支付暂行规定（1994年版）》第六条：用人单位应将工资支付给劳动者本人，并可委托银行代发工资，但并未禁止其他合法支付方式，如微信转账。同时，该规定要求用人单位必须书面记录支付劳动者工资的数额、时间、领取者的姓名以及签字，并保存两年以上备查，这同样适用于微信转账的情况。

合法情况

1. 双方约定：用人单位与劳动者可在劳动合同中约定通过微信转账发放工资，只要双方同意且不违反法律规定。
2. 合规操作：微信转账作为电子支付方式，其合法性在于是否按照法律法规进行申报、记录和缴纳相关税费，以及是否保留了完整的支付记录。

不合法情况及潜在风险

1. 逃避义务：若公司利用微信转账逃避社保缴纳和个人纳税义务，则属于违法行为。
2. 记录缺失：微信转账记录作为电子证据，证明效力可能较弱，易被篡改或删除。缺乏规范记录可能导致劳动纠纷时难以核实工资支付情况。
3. 税务风险：隐瞒工资收入、虚假申报个人所得税等可能导致税务违法行为。微信转账的隐蔽性增加了税务机关的监管难度。

合规建议与措施

1. 规范操作流程：
   • 制定详细的微信转账发工资操作流程，明确时间、方式、金额等细节。
   • 建立健全工资支付台账，详细记录每一笔转账信息，包括数额、时间、领取者姓名及确认收款的信息，确保真实性和完整性，以满足《工资支付暂行规定》的要求。
2. 加强证据留存：
   • 保存微信转账记录截图、聊天记录、工资确认信息等相关资料。
   • 签订工资支付协议，明确支付方式和相关事项，增强证据效力。
3. 确保合规报税：
   • 如实申报个人所得税，避免逃税行为。
   • 配合税务机关检查，提供必要的转账记录和资料。
4. 谨慎操作与保存记录：
   • 确保转账信息准确无误，及时与员工确认收款情况。
   • 妥善保存所有转账记录，以备不时之需。

实际操作中的注意事项

1. 优先采用银行代发：通过企业对公账户直接转账至员工银行卡，既符合监管要求，又能自动生成可查询的流水记录，减少潜在风险。
2. 补充书面协议：若确需使用微信转账，应与员工签订书面协议明确支付方式及双方权利义务，降低法律风险。
3. 强化财务管理：建立完整的工资支付台账，保存微信转账凭证、聊天记录等证据材料，定期与员工核对账目，确保工资支付的准确性和合规性。

总结来看，微信转账发工资在合法合规的前提下是可行的，但用人单位需严格遵守相关法律法规，规范操作流程，加强证据留存，并确保合规报税。如果你在工资福利方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。