针对您提出的“军人有妻子还养小三怎么处罚”这一问题，我会从纪律处分、法律追究以及思想教育三个方面为您详细解答。
一、纪律处分
军人作为国家的守护者，必须严格遵守社会公德和家庭美德，这是其职业特性和社会角色所决定的。根据《中国人民解放军纪律条令》等相关规定，军人不得有违背公序良俗的行为，包括与“小三”保持不正当关系。一旦发现此类行为，军队将视情节轻重给予相应的纪律处分，如警告、记过、降职（级）或撤职等。这些处分措施旨在维护军队的纪律性和纯洁性，确保军人能够以身作则，树立良好的社会形象。
二、法律追究
军人的婚外情行为不仅违反了军纪，还可能触犯法律法规，需要承担相应的法律责任。
民事责任：如果军人的婚外情行为对配偶造成了精神损害或其他损失，配偶有权依法提起离婚诉讼，并要求过错方承担相应的民事赔偿责任。这包括赔偿因过错行为导致的财产损失和精神损害抚慰金等。通过法律途径，配偶可以维护自己的合法权益，让过错方承担应有的法律责任。
刑事责任：在特定情况下，军人的婚外情行为还可能构成犯罪。例如，如果军人利用职权、从属关系，以胁迫手段奸淫现役军人的妻子的，将依照刑法相关规定定罪处罚。此外，如果军人的婚外情行为涉及重婚或与其他女性以夫妻名义共同生活等情形，也可能构成重婚罪，面临刑事处罚。这些刑事责任是法律对军人婚外情行为的严厉制裁，旨在维护社会的公序良俗和法律的尊严。
三、思想教育
除了纪律处分和法律追究外，军队还将对涉事军人进行深刻的思想教育。通过谈话、辅导等方式，帮助其认识到自己的错误，树立正确的价值观和婚姻观。思想教育是纠正军人错误行为、防止类似事件再次发生的重要手段。通过思想教育，军人可以深刻反思自己的行为，认识到自己的错误，并积极改正错误，修复家庭关系，重新赢得组织和群众的信任。
综上所述，军人有妻子还养小三的行为将受到纪律处分、法律追究以及思想教育等多方面的处理。这些处理措施旨在维护军队的纪律性和纯洁性，保护军人的家庭和社会形象，同时也体现了法律对军人行为的严格要求和规范。