在合同中明确约定了仲裁条款的情况下，发生纠纷时，一般只能通过仲裁解决，而不能直接向法院起诉。以下是对这一问题的详细分析：

仲裁条款的效力

1. 仲裁协议的独立性：根据《中华人民共和国仲裁法》的相关规定，仲裁协议独立存在，合同的变更、解除、终止或者无效，不影响仲裁协议的效力。这意味着，即使合同本身存在问题或被解除，仲裁条款仍然有效，双方仍需通过仲裁解决纠纷。

2. 仲裁的排他性：仲裁条款通常具有排他性，即双方约定通过仲裁解决纠纷后，就排除了法院对同一纠纷的管辖权。这是仲裁制度的一个重要特点，旨在确保纠纷解决的效率和专业性。

起诉的可能性与限制

1. 一般情况下的起诉限制：在合同中明确约定了仲裁条款的情况下，如果一方直接向法院起诉，法院通常会根据仲裁条款裁定不予受理或驳回起诉。这是因为仲裁条款已经对纠纷解决方式作出了明确约定，法院应当尊重双方的意愿。

2. 例外情况：虽然仲裁条款具有排他性，但在某些特殊情况下，法院仍可能对纠纷进行管辖。例如，如果仲裁条款无效（如因违反法律强制性规定或公共秩序而无效），或者一方在仲裁庭首次开庭前未对仲裁协议的效力提出异议而在后续诉讼中提出，法院可能会受理案件。然而，这些情况相对较少见，且需要满足一定的法律条件。

实际操作建议

1. 审查合同条款：在签订合同时，务必仔细审查合同中的仲裁条款，确保其内容明确、合法有效。如果对仲裁条款有疑问或不确定其效力，建议咨询专业律师。

2. 遵守仲裁程序：如果合同中确实约定了仲裁条款，且该条款有效，那么在发生纠纷时，双方应当遵守仲裁程序，通过仲裁解决纠纷。这有助于维护双方的合法权益，避免不必要的法律纠纷和成本。

3. 考虑特殊情况：虽然仲裁条款通常具有排他性，但在某些特殊情况下（如仲裁条款无效或一方在仲裁庭首次开庭前未提出异议），法院仍可能对纠纷进行管辖。因此，在面临纠纷时，双方应当根据实际情况和法律规定，灵活选择纠纷解决方式。

总结来说，合同中约定仲裁条款后，发生纠纷时一般只能通过仲裁解决。然而，在特定情况下（如仲裁条款无效或一方在仲裁庭首次开庭前未提出异议），法院仍可能对纠纷进行管辖。因此，在签订合同时务必仔细审查仲裁条款，并在发生纠纷时根据实际情况和法律规定选择合适的纠纷解决方式。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。