车祸住院41天的出院费用计算需结合事故责任、保险覆盖及实际损失综合判定，具体分以下情况处理：

1. 责任明确时的费用承担
   若事故责任已由交警《事故责任认定书》明确（如全责、主次责等），责任方需承担全部或部分医疗费用。

   • 全责方：需赔偿受害者全部合理医疗费（包括住院费、药品费、检查费、护理费等），需保留医院出具的正式发票、费用清单、诊断证明等凭证。
     
   • 部分责任：按责任比例分担费用（如主责70%、次责30%），需通过协商或诉讼确定具体比例。

2. 保险理赔的覆盖范围
   若责任方投保了交强险或商业三者险，费用可由保险公司赔付，但需注意：

   • 交强险：医疗费用限额为1.8万元（含住院费、药费等），超出部分由商业险或责任方承担。
     
   • 商业险：根据保单约定赔付，需提供完整医疗资料及事故证明。
     
   • 提示：保险公司可能对非医保用药、过度治疗等费用拒赔，需提前与保险公司沟通或通过法律途径解决。

3. 实际损失的合理性审查
   费用需符合“必要性、合理性”原则，例如：

   • 住院天数需与伤情匹配（如41天是否因伤情必要，或存在挂床现象）；
     
   • 药品及治疗项目需为治疗所必需（如进口药、高端检查需医生明确说明必要性）；
     
   • 护理费、营养费等需有医嘱或鉴定意见支持。
     若对方质疑费用合理性，可能需通过司法鉴定确认。

4. 特殊情形处理

   • 无责任方：若受害者无责且未获赔偿，可申请道路交通事故社会救助基金垫付（需符合条件）；
     
   • 争议解决：若协商不成，可通过交警调解、人民调解委员会调解或直接向法院起诉，诉讼时需提交医疗费证据、责任认定书等材料。

行动建议：

1. 立即收集所有医疗票据、费用清单、诊断证明、病历等材料；
   
2. 联系责任方或保险公司协商赔偿，明确赔偿项目及金额；
   
3. 若协商受阻，可委托律师介入谈判或直接起诉，通过法律程序主张权益。
   

如有具体费用明细或责任争议，可进一步提供信息，我会为您详细分析赔偿方案。