道路客运企业违规车辆比例达到20%以上时，可能面临停业整顿的处罚，但具体需结合违规性质、情节严重程度及地方性法规综合判断。以下从不同角度展开分析：

1. 法律法规的直接规定

根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十九条及《道路旅客运输及客运站管理规定》第九十七条，若客运企业存在“使用无道路运输证的车辆参加客运经营”或“超越许可事项从事道路客运经营”等违规行为，且情节严重的，交通运输主管部门可责令停业整顿。
关键点：

• “情节严重”的认定：通常需结合违规车辆数量、比例、违规频率、是否造成安全事故等因素综合判断。
  
• 比例参考：部分地方性法规（如《XX省道路运输条例》）可能明确规定“违规车辆占企业车辆总数20%以上”属于情节严重，但国家层面无统一比例标准，需以地方规定为准。

2. 地方性法规的细化规定

不同省份可能对“停业整顿”的触发条件作出具体规定。例如：

• 某省规定：若客运企业“违规车辆比例达到20%且拒不整改”，或“一年内累计违规车辆超过30%”，可责令停业整顿30日。
  
• 另一省规定：以“违规车辆数”而非比例作为标准，如“企业名下5辆以上客车无道路运输证从事经营”即触发停业整顿。
  建议：需查询企业注册地或经营地的具体地方性法规，以确定准确比例或数量标准。

3. 行政处罚的自由裁量权

即使违规车辆比例未达到地方性法规的明确标准，若存在以下情形，交通运输主管部门仍可能责令停业整顿：

• 安全隐患突出：如违规车辆存在严重机械故障、超员超速等违法行为；
  
• 拒不整改：对前期下达的整改通知置之不理；
  
• 社会影响恶劣：如违规行为引发群体性事件或重大舆情。
  案例参考：某客运企业因15%的车辆无道路运输证，但存在多次超员载客行为，最终被认定为“情节严重”并停业整顿15日。

4. 企业合规建议

为避免停业整顿风险，客运企业应：

• 定期自查：建立车辆合规档案，确保所有车辆证照齐全、技术状况良好；
  
• 动态监控：利用GPS等系统实时监控车辆运行状态，杜绝超员、超速等行为；
  
• 及时整改：对主管部门指出的违规问题，需在规定期限内完成整改并提交报告。

温馨提示：若您企业涉及具体违规情形或需进一步了解地方性规定，可直接向我咨询，我将结合实际情况为您提供详细应对方案。