针对您提出的“本地区基层税务局起诉本地税务局的管辖权如何确定”的问题，这主要涉及到行政诉讼中的管辖权规定，特别是在税务纠纷行政案件中的特殊安排。以下是根据相关法律法规及上海市的具体实践，给出的详细解答：
首先，需要明确的是，在行政诉讼中，管辖权的确定通常遵循《中华人民共和国行政诉讼法》的相关规定。对于税务纠纷行政案件，为了优化营商环境并依法公正审理，一些地区（如上海市）会采取集中管辖的方式。
以上海市为例：
一审行政案件的管辖：
- 自2024年2月23日起，上海铁路运输法院集中管辖原由本市基层人民法院管辖的以税务部门为被告的一审行政案件。这意味着，如果基层税务局作为被告被起诉，案件将由上海铁路运输法院负责审理。
- 浦东新区、闵行区、静安区人民法院等基层法院不再受理此类案件。
二审行政案件的管辖：
- 同样自2024年2月23日起，上海市第三中级人民法院集中管辖原由本市相关中级人民法院管辖的以税务部门为被告的一审行政案件和以税务部门为被上诉人或上诉人的二审行政案件。
- 上海市第一中级人民法院和上海市第二中级人民法院不再受理上述二审案件。
特殊情况的处理：
- 对于2024年2月23日以前已经受理但尚未审结的案件，依法由受理法院继续审理。
- 如果案件已经收取材料但尚未登记立案，法院会告知当事人按照新的级别管辖规定向上海铁路运输法院或上海市第三中级人民法院提起诉讼，或者将材料移送至相应法院并告知当事人。
再审案件的管辖：
- 当事人认为基层人民法院作出的以税务部门为被告的生效行政判决、裁定或者调解书确有错误的，可以向上海市第三中级人民法院申请再审。
- 如需再审，由上海市第三中级人民法院依法裁定提审或者指令作出生效行政判决、裁定或者调解书的基层人民法院再审。
对于其他地区：
虽然上述解答是基于上海市的具体实践，但其他地区在处理税务纠纷行政案件时，也可能采取类似的集中管辖方式或遵循《中华人民共和国行政诉讼法》的一般规定。因此，如果您所在的地区不是上海市，建议您：
- 查阅当地高级人民法院或中级人民法院发布的相关规定或通知，了解具体的管辖权安排。
- 咨询当地律师或法律服务机构，获取更具体、更针对性的法律建议。
综上所述，本地区基层税务局起诉本地税务局的管辖权确定，主要依据当地的法律法规和具体实践。在上海市，这类案件通常由上海铁路运输法院和上海市第三中级人民法院集中管辖。对于其他地区，建议您查阅相关规定或咨询专业律师以获取准确信息。