机动车维修经营者未按规定备案的，将面临责令改正及罚款的行政处罚。具体分析如下：

1. 法律依据
   根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十五条及《机动车维修管理规定》第四十九条，机动车维修经营者需在完成工商登记后，向所在地交通运输主管部门进行备案。若未按规定备案，属于违法行为。

2. 处罚措施

   • 责令改正：交通运输主管部门会首先要求经营者限期补办备案手续。
     
   • 罚款：若逾期未改正，将处以5000元以上2万元以下罚款。
     
   • 情节严重情形：若经营者同时存在其他违法行为（如使用假冒伪劣配件、签发虚假维修证明等），可能面临更高额罚款、停业整顿，甚至吊销经营许可的叠加处罚。

3. 实务建议

   • 及时补办备案：发现未备案后，应立即向当地交通运输主管部门提交材料（包括营业执照、场地证明、技术人员资质等），避免罚款升级。
     
   • 合规经营：备案后需严格遵守维修技术规范、配件采购记录等要求，否则可能因其他违规行为被追加处罚。
     
   • 行政复议或诉讼：若对处罚有异议，可在收到处罚决定书后60日内申请行政复议，或6个月内直接向法院起诉。

温馨提示：机动车维修行业涉及公共安全，备案是合法经营的前提。如有进一步疑问或需协助处理具体案件，可直接向我咨询。