合法使用的宅基地主要包括以下几种情况：
依法取得审批手续的宅基地：
- 农民通过合法程序，如向村委会申请、乡镇政府审核、县级政府批准等流程，依法取得的宅基地使用权，是合法使用的。这种宅基地的使用权受到法律保护，农民可以在其上建造房屋并居住使用。
历史原因形成的宅基地：
- 在一些地区，由于历史原因，农民在未经过完整审批程序的情况下就已占有并使用了宅基地。对于这类宅基地，如果符合当地土地利用总体规划和村庄规划，且未侵犯他人合法权益，通常也会被认定为合法使用。但需要注意的是，随着法律法规的完善，这类宅基地的使用者应尽快补办相关审批手续，以确保其合法性。
继承或受赠取得的宅基地：
- 农民通过继承或受赠方式取得的宅基地使用权，如果原宅基地使用权是合法取得的，那么继承或受赠后的宅基地使用权也是合法的。但同样需要注意的是，继承或受赠后应办理相关变更登记手续，以确认新的使用权人。
符合“一户一宅”原则的宅基地：
- 根据相关法律法规，农村村民一户只能拥有一处宅基地。如果农民拥有的宅基地符合这一原则，且面积未超过当地规定的标准，那么该宅基地就是合法使用的。
在判断宅基地是否合法使用时，还需要注意以下几点：
- 宅基地的面积是否超标：不同地区对宅基地的面积有具体规定，如果宅基地面积超过了当地规定的标准，那么超出部分可能不被认定为合法使用。
- 宅基地的使用是否符合规划：宅基地的使用应符合当地土地利用总体规划和村庄规划，如果违反了规划要求，那么该宅基地的使用可能被视为非法。
- 是否存在权属纠纷：如果宅基地存在权属纠纷，如多户争抢同一宅基地等，那么在纠纷解决前，该宅基地的使用可能无法被认定为合法。
如果宅基地使用存在问题，可能会面临以下法律后果：
- 如果宅基地使用违反了相关法律法规或规划要求，可能会面临被责令退还非法占用的土地、限期拆除在非法占用的土地上新建的房屋等处罚。
- 如果宅基地存在权属纠纷，且无法通过协商解决，那么可能需要通过法律途径来确认权属，这可能会耗费大量的时间和精力。
建议：
- 农民在使用宅基地时，应严格遵守相关法律法规和规划要求，确保宅基地的合法使用。
- 如果对宅基地的合法性存在疑问，或者面临宅基地权属纠纷等问题，应及时咨询专业律师或相关部门，以获取准确的法律意见和帮助。
如有任何关于宅基地使用的法律问题，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律解答。