结论：劳务派遣员工的工资一般应由劳务派遣单位发放，这是基于《中华人民共和国劳动合同法》及相关法规的明确规定。尽管在实际操作中可能存在用工单位代发工资的情况，但这并不改变劳务派遣单位作为工资支付主体的法律责任。
一、法律规定与工资支付主体
《中华人民共和国劳动合同法》第五十八条：
- 劳务派遣单位是本法所称的用人单位，应当履行用人单位对劳动者的义务，其中核心义务之一便是向被派遣劳动者支付劳动报酬。
- 劳务派遣单位应当与被派遣劳动者订立二年以上的固定期限劳动合同，按月支付劳动报酬；被派遣劳动者在无工作期间，劳务派遣单位应当按照所在地人民政府规定的最低工资标准，向其按月支付报酬。
《中华人民共和国劳动合同法》第六十条：
- 劳务派遣单位不得克扣用工单位按照劳务派遣协议支付给被派遣劳动者的劳动报酬，这进一步强调了劳务派遣单位在工资支付方面的责任。
《劳务派遣暂行规定》第八条：
- 劳务派遣单位应当按照国家规定和劳务派遣协议约定，依法支付被派遣劳动者的劳动报酬和相关待遇，这是对劳务派遣单位工资支付义务的具体细化。
二、实际操作中的工资发放情况
一般情况：
- 在大多数情况下，劳务派遣单位会按照法律规定和劳动合同约定，直接向被派遣劳动者发放工资。
特殊情况：
- 实际操作中，可能存在用工单位代发工资的情况。这种代发行为通常基于劳务派遣单位和用工单位之间的劳务派遣协议约定，或者为了提高工资发放的效率和便利性。
- 然而，即使存在用工单位代发工资的情况，劳务派遣单位仍然对工资支付承担法定责任。如果发生工资支付问题，如拖欠、克扣等，劳务派遣单位不能以约定了用工单位代发为由逃避其法律责任。
三、工资发放的责任与权益保障
劳务派遣单位的责任：
- 劳务派遣单位作为工资支付的主体，必须确保按时足额发放工资，并依法为劳动者缴纳社会保险等费用。
- 若劳务派遣单位未按时足额发放工资，劳动者可以依法向其主张权利，要求支付工资及相应赔偿。
劳动者的权益保障：
- 劳动者在遇到工资问题时，应首先尝试与劳务派遣单位协商解决。
- 协商不成时，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
四、建议与注意事项
对于劳务派遣单位：
- 应严格遵守相关法律法规，确保按时足额发放工资，避免法律风险。
- 在与用工单位签订劳务派遣协议时，应明确约定工资支付的方式、时间、标准等，以保障劳动者的合法权益。
对于劳动者：
- 在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，了解工资支付的相关规定。
- 在遇到工资问题时，应保留好相关证据，如工资条、银行转账记录等，以便在维权时提供有力支持。
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