小偷深夜进入院中的行为是违法的。以下从不同角度对此问题进行分析：
从侵犯住宅安宁权的角度：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，自然人享有住宅安宁权，即任何组织或者个人不得以刺探、侵扰、泄露、公开等方式侵害他人的隐私权，其中就包括非法侵入他人住宅的行为。小偷深夜进入院中，即使未进入住宅内部，也已对住宅的安宁环境造成了破坏，侵犯了住宅安宁权，属于违法行为。
从盗窃罪的角度：
- 如果小偷进入院中的目的是为了实施盗窃行为，那么根据《中华人民共和国刑法》的规定，以非法占有为目的，秘密窃取公私财物数额较大或者多次盗窃、入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃的，构成盗窃罪。在此情况下，小偷深夜进入院中的行为不仅是违法的，还可能构成犯罪，需要承担刑事责任。
从治安管理处罚的角度：
- 即使小偷进入院中的行为未构成盗窃罪，但如果其违反了治安管理规定，如非法侵入他人住宅、扰乱公共秩序等，根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的规定，公安机关可以对其处以警告、罚款、拘留等行政处罚。
法律建议：
- 如果您发现有小偷深夜进入院中，应立即报警并保护好现场，以便公安机关进行调查取证。
- 同时，您可以考虑加强住宅的安全防范措施，如安装防盗门、防盗窗、监控摄像头等，以提高住宅的安全性。
可能的法律后果：
- 对于小偷而言，其可能面临刑事处罚或行政处罚，具体取决于其行为的性质和情节。
- 对于您而言，如果因小偷的行为导致财产损失或人身伤害，您可以依法向小偷提起民事诉讼，要求其承担赔偿责任。
综上所述，小偷深夜进入院中的行为是违法的，可能构成犯罪或违反治安管理规定。如果您遇到此类情况，请及时报警并寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。