是的，公司制诊所通常是先成立公司，再以公司为主体申请诊所的设立许可。具体分析如下：

1. 法律主体资格要求
   根据《医疗机构管理条例》及实施细则，诊所属于医疗机构，其设立主体需具备独立法人资格或符合条件的自然人。若选择公司制模式，需先依据《公司法》完成公司注册登记（如有限责任公司或股份有限公司），取得营业执照后，方可以公司名义向卫生健康行政部门申请《医疗机构执业许可证》。

2. 设立流程的合规性

   • 第一步：公司设立
     需完成工商核名、章程制定、股东出资、注册地址确认等程序，最终领取营业执照。此阶段需满足《公司法》关于注册资本、股东结构等要求，例如医疗类公司可能需实缴注册资本或特定专业背景的股东。
     
   • 第二步：诊所许可申请
     以公司为主体提交材料，包括但不限于：
     
     • 医疗机构设置可行性研究报告；
       
     • 选址报告及建筑设计平面图；
       
     • 法定代表人及主要负责人资质证明（如医师执业证书）；
       
     • 消防、环保等部门出具的合格证明。
       卫生健康部门审核通过后，颁发《医疗机构执业许可证》，诊所方可正式运营。

3. 例外情形与风险提示

   • 政策差异：部分地区可能允许“先许可后登记”的试点模式（如自贸区），但需以当地卫健委和工商部门的最新政策为准。
     
   • 资质衔接：若公司股东或高管不具备医疗专业资质，可能需通过聘用执业医师等方式满足许可条件，否则可能因主体不适格被驳回申请。
     
   • 责任承担：公司制诊所的医疗纠纷责任由公司承担，但若存在股东滥用公司法人地位等情形，可能触发“法人人格否认”制度，导致股东承担连带责任。

建议：若计划设立公司制诊所，可先向当地卫生健康行政部门确认许可要求，再同步推进公司注册与许可申请流程，确保两阶段资质衔接顺畅。如有具体操作疑问，可进一步向我咨询。