结论：因民间借贷被拘留12天是否会有案底，取决于拘留的性质。如果是司法拘留，则不会留下刑事案底；如果是刑事拘留且后续被认定构成犯罪，则会留下案底。
详细分析：
司法拘留的情况：
- 在民间借贷案件的执行阶段，如果被执行人有能力履行却拒不履行人民法院已经发生法律效力的判决、裁定，如隐藏、转移财产等行为，法院有权对其予以司法拘留。
- 司法拘留的期限一般不超过十五日，且不会留下刑事案底。因为司法拘留是对妨害民事诉讼行为的一种制裁措施，并非刑事处罚。但需要注意的是，司法拘留的记录会在法院系统中留存，可能对个人社会信用、商业活动等产生负面影响。例如，可能会影响个人在银行的贷款申请、信用卡办理等。
刑事拘留的情况：
- 单纯的民间借贷纠纷通常不会涉及刑事拘留。但如果借贷过程中存在诈骗、非法集资等犯罪行为，或者当事人拒不执行法院判决构成拒不执行判决、裁定罪，则可能会被采取刑事拘留措施。
- 一旦被认定构成犯罪并受到刑事处罚，就会留下案底。这个案底会伴随终身，对个人及子女的就业、入伍、报考军警院校等方面可能产生影响。例如，某些职业如公务员、律师等，在入职前都需要进行政审，案底可能会成为政审不通过的原因。
建议：
- 如果您因民间借贷被拘留，首先需要明确拘留的性质。如果是司法拘留，虽然不会留下刑事案底，但仍需重视法院的判决和裁定，积极履行义务，以避免进一步的法律后果。
- 如果是刑事拘留，且您认为自己并未构成犯罪，或者对拘留有异议，建议及时向我咨询，了解具体的法律程序和维权途径。
- 在处理民间借贷问题时，建议当事人遵守相关法律法规，诚信为本，避免不必要的法律风险和纠纷。如果遇到法律问题，可以直接向我提问，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。