非法改装车辆被扣押的流程及法律依据如下：

1. 扣押的法定情形
   根据《道路交通安全法》第16条及《机动车登记规定》第79条，非法改装车辆（如改变车身颜色未备案、更换发动机/车架未登记、加装尾翼/大包围等影响安全性能的改装）被交警查获后，公安机关交通管理部门有权扣留机动车，并责令恢复原状。

2. 扣押的具体流程

   • 现场查获：交警发现车辆存在非法改装行为（如外观、动力系统、排气装置等与行驶证登记不符），会要求车主出示行驶证、驾驶证，并初步核查改装情况。
     
   • 扣押决定：若确认改装违法，交警会开具《公安交通管理行政强制措施凭证》，当场扣留车辆，并告知车主在15日内到指定地点接受处理。
     
   • 后续处理：车主需在规定期限内携带身份证、行驶证、车辆合格证等材料，到交警部门接受处罚（通常包括罚款、责令恢复原状），并凭《放行单》领回车辆。若逾期未处理，车辆可能被依法拍卖或报废。

3. 扣押期间的权利与义务

   • 车主权利：有权要求交警出示执法证件、查看扣押依据；对扣押决定不服的，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
     
   • 车主义务：不得擅自转移、损毁被扣押车辆；需配合交警调查，按要求整改车辆。

4. 特殊情形处理

   • 改装未影响安全：若改装仅涉及非关键部件（如贴膜、更换轮毂样式），且符合《机动车运行安全技术条件》（GB7258）标准，可能仅被责令整改而不扣押。
     
   • 拒不整改：若车主拒绝恢复原状，交警可强制拖移车辆，并处500元以下罚款；情节严重的，可能吊销驾驶证。

建议：若您的车辆被扣押，请第一时间核对扣押凭证上的违法事实描述是否准确，并尽快联系专业机构恢复车辆原状。如有疑问，可直接向我咨询具体流程或证据固定方法。