针对医疗器械组成部分与注册证登记不符的处罚依据，主要可以从以下几个方面进行分析：
法律法规依据：
- 根据《医疗器械监督管理条例》的相关规定，医疗器械的注册人、备案人应当确保其提交的注册或者备案资料真实、准确、完整和可追溯。若医疗器械的组成部分与注册证登记的不符，这明显违反了医疗器械注册管理的核心要求，即确保医疗器械的安全性和有效性。
- 具体来说，如果医疗器械的组成部分发生了变更，而注册人未按照规定进行变更注册或者备案，那么根据《医疗器械监督管理条例》第八十四条，将由负责药品监督管理的部门责令改正，给予警告，并处1万元以上10万元以下罚款；情节严重的，责令停产停业，直至由原发证部门吊销医疗器械生产许可证、医疗器械经营许可证。
处罚的考量因素：
- 处罚的严重程度通常会考虑多个因素，包括但不限于违规行为的性质、情节、后果以及注册人的主观过错程度等。例如，如果违规行为导致了严重的医疗事故或者患者伤害，那么处罚将会更加严厉。
- 另外，如果注册人能够积极配合调查，主动采取措施纠正违规行为，并减轻或者消除不良后果，那么根据相关规定，可以从轻或者减轻处罚。
实际操作中的建议：
- 对于医疗器械注册人来说，应当严格遵守相关法律法规，确保医疗器械的组成部分与注册证登记的一致。如果需要进行变更，应当及时按照规定进行变更注册或者备案。
- 如果发现医疗器械的组成部分与注册证登记的不符，应当立即停止生产、销售和使用该医疗器械，并主动向负责药品监督管理的部门报告，配合调查并采取措施纠正违规行为。
总结来说，医疗器械组成部分与注册证登记不符是严重的违规行为，将受到法律的严厉处罚。作为医疗器械注册人，应当严格遵守相关法律法规，确保医疗器械的安全性和有效性。如果遇到相关问题或者需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。