在清算夫妻共同存款时，中途转出的款项是否算入共同财产，需根据转出时间、用途及双方约定等因素综合判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 转出时间与婚姻状态

• 婚姻关系存续期间转出：若存款在婚姻关系存续期间被转出，且未明确约定为个人财产，通常视为夫妻共同财产。即使款项被转出，仍可能被纳入清算范围，除非能证明转出款项用于夫妻共同生活或经营（如支付家庭开支、投资等）。
• 离婚后转出：若存款在离婚后被转出，且离婚时已对共同财产进行分割，转出款项一般不再属于共同财产。但若转出行为涉及隐藏、转移、变卖夫妻共同财产，可能面临法律追责。

2. 转出用途与性质

• 用于夫妻共同生活或经营：若转出款项用于家庭开支、子女教育、医疗费用或共同投资等，通常视为合理支出，不影响共同财产的认定。但需保留相关证据（如转账记录、发票等）以证明用途。
• 用于个人目的或非法用途：若转出款项用于个人消费（如购买奢侈品、赌博等）或非法活动，可能被认定为恶意转移财产，转出部分仍可能被纳入共同财产清算范围，且转出方可能面临少分或不分财产的后果。

3. 双方约定与协议

• 婚前或婚内协议：若夫妻双方在婚前或婚内签订了财产协议，明确约定了存款的归属或转出规则，则按协议执行。例如，协议约定某笔存款为个人财产，转出时无需纳入共同财产清算。
• 离婚协议：若离婚时双方已就共同财产分割达成协议，且协议中明确约定了存款的分配方式，转出行为需符合协议约定。否则，可能因违反协议而承担法律责任。

4. 法律后果与追责

• 隐藏、转移财产的法律后果：根据《中华人民共和国民法典》第一千零九十二条，夫妻一方隐藏、转移、变卖、毁损、挥霍夫妻共同财产，或伪造夫妻共同债务企图侵占另一方财产的，在离婚分割夫妻共同财产时，对该方可以少分或者不分。离婚后，另一方发现有上述行为的，可以向人民法院提起诉讼，请求再次分割夫妻共同财产。
• 举证责任：若一方主张转出款项不属于共同财产，需承担举证责任，证明转出行为的合理性及款项用途。否则，可能承担不利法律后果。

5. 实务建议

• 保留证据：无论是转出方还是接收方，都应保留转账记录、聊天记录、协议等证据，以证明转出行为的合法性及款项用途。
• 协商解决：在清算共同财产时，双方可协商解决转出款项的归属问题，避免法律纠纷。
• 法律途径：若协商无果，可向人民法院提起诉讼，由法院根据事实和法律作出判决。

总结：清算夫妻共同存款时，中途转出的款项是否算入共同财产，需结合转出时间、用途、双方约定及法律后果等因素综合判断。建议您根据具体情况保留相关证据，并在必要时咨询专业律师以维护自身权益。