针对您提出的“特种设备立案期间已整改的处罚吗”这一问题，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确的是，特种设备的安全管理受到《中华人民共和国特种设备安全法》等法律法规的严格规范。当特种设备存在安全隐患或违法行为时，相关部门会依法进行立案调查。

关于立案期间已整改的处罚问题：

1. 直接处罚与限期整改的区别：

   • 在某些特种设备违法行为中，如违法使用未经检验的特种设备，法律可能规定直接进行处罚，而不是先给予限期整改的机会。例如，根据《中华人民共和国特种设备安全法》的相关规定，违法使用未经检验的特种设备是直接处罚的情形。

2. 整改对处罚的影响：

   • 尽管在立案期间进行了整改，但这并不意味着可以免除处罚。整改是违法行为发生后的补救措施，而处罚是对违法行为的法律制裁。然而，整改情况可能会作为处罚裁量时的考虑因素，如从轻或减轻处罚的依据。
   • 以您提供的案例为例，某医院在执法检查后积极联系电梯维保单位和检验机构办理定期检验等相关事宜，这一整改行为被市场局案审会考虑，并决定对该医院非法使用电梯的行为予以从轻处罚。

3. 处罚的法定程序：

   • 无论是否整改，相关部门在立案后都会依法进行调查取证、审查案件、告知当事人违法事实及享有的权利、作出行政处罚决定等法定程序。
   • 如果当事人对处罚决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。

总结与建议：

• 特种设备立案期间已整改并不意味着可以免除处罚，但整改情况可能会作为处罚裁量时的考虑因素。
• 建议您在面临特种设备安全问题时，及时咨询专业律师或相关部门的意见，了解具体的法律责任和处罚规定。
• 同时，加强特种设备的安全管理，定期进行检验和维护，确保设备的安全运行，是避免违法行为和处罚的关键。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。