结论前置：怀孕期间女方发现男方出轨，女方当然可以起诉，但起诉的内容和目的不同，对应的法律程序和结果也会有所差异，以下从不同角度为你详细分析。
一、起诉离婚
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条的规定，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。其中，重婚或者与他人同居属于感情确已破裂的情形之一。
分析说明：
- 如果女方在怀孕期间发现男方出轨，且出轨行为构成了重婚或者与他人同居等严重情形，女方可以向人民法院提起离婚诉讼。
- 法院在审理时，会首先进行调解，如果调解无效，且确认感情确已破裂，法院会准予离婚。
- 需要注意的是，虽然法律没有明确规定怀孕期间女方不能提出离婚，但出于对孕妇和胎儿的保护，法院在判决时可能会更加谨慎。
特殊情形：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一千零八十二条的规定，女方在怀孕期间、分娩后一年内或者终止妊娠后六个月内，男方不得提出离婚；但是，女方提出离婚或者人民法院认为确有必要受理男方离婚请求的除外。这意味着，在女方怀孕期间，男方通常不能提出离婚，但女方可以。
二、起诉要求损害赔偿
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一千零九十一条的规定，有下列情形之一，导致离婚的，无过错方有权请求损害赔偿：（一）重婚；（二）与他人同居；（三）实施家庭暴力；（四）虐待、遗弃家庭成员；（五）有其他重大过错。
分析说明：
- 如果男方在女方怀孕期间出轨，且出轨行为构成了上述条款中的情形之一（如重婚、与他人同居等），女方在提起离婚诉讼的同时，可以要求男方进行损害赔偿。
- 损害赔偿的范围可能包括物质损害赔偿和精神损害赔偿，具体数额由法院根据实际情况判决。
三、起诉要求确认亲子关系或否认亲子关系（如涉及非婚生子女）
法律依据：
- 虽然直接的法律条款可能并未明确提及怀孕期间出轨与亲子关系确认或否认的直接关联，但根据《中华人民共和国民法典》中关于亲子关系的相关规定，父母子女关系是基于出生事实而形成的法律关系。
- 如果男方出轨导致非婚生子女的出生，或者女方怀疑非婚生子女与男方无亲子关系，可以通过法律途径进行亲子关系的确认或否认。
分析说明：
- 在这种情况下，女方可能需要通过亲子鉴定等科学手段来证明或否认亲子关系。
- 如果确认存在亲子关系，女方可以要求男方承担抚养责任；如果否认存在亲子关系，则男方无需承担抚养责任，但可能需要承担其他法律责任（如欺诈性抚养的赔偿等）。
四、其他注意事项
- 证据收集：在提起任何诉讼之前，女方应尽可能收集男方出轨的证据，如聊天记录、照片、视频等，以便在诉讼中证明自己的主张。
- 法律咨询：由于法律程序复杂且涉及个人权益重大，建议女方在提起诉讼前咨询专业律师（也就是我啦），以获取更具体的法律建议和指导。
- 心理调适：怀孕期间遭遇男方出轨对女方的心理打击巨大，建议女方在处理法律事务的同时，也注重自己的心理调适和身体健康。
总结与建议：怀孕期间女方发现男方出轨，女方可以起诉离婚、要求损害赔偿或确认/否认亲子关系等。具体选择哪种方式取决于女方的实际情况和诉求。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。