结论：大车被交警扣留且发现存在两个大架子号（车辆识别代号，VIN）的情况，属于较为严重的违法行为，车辆可能会被依法扣留并进一步调查处理，车主或驾驶人可能面临行政处罚甚至刑事责任追究，具体处理方式需根据实际情况确定。以下从不同角度进行分析：

1. 法律定性角度

根据《中华人民共和国道路交通安全法》第十六条：“任何单位或者个人不得有下列行为：……（二）改变机动车型号、发动机号、车架号或者车辆识别代号；……”车辆识别代号（VIN）是车辆的唯一身份标识，具有法定性和唯一性。若车辆存在两个VIN，可能涉及以下情形：

• 伪造或变造VIN：若其中一个VIN是伪造或变造的，属于违法行为，可能触犯《道路交通安全法》第九十六条，面临罚款、拘留等处罚。
• 套牌或拼装车：若车辆是拼装或套牌车（即使用其他车辆的VIN），则属于严重违法行为，车辆可能被没收并强制报废，相关责任人可能面临刑事责任追究。

2. 处理流程角度

交警扣留车辆后，通常会按以下流程处理：

• 调查核实：交警会核对车辆登记信息、行驶证、合格证等，确认VIN的真实性和合法性。
• 委托鉴定：若怀疑车辆存在拼装、套牌或伪造VIN，交警可能委托专业机构进行鉴定。
• 行政处罚：根据调查结果，对违法行为人（车主或驾驶人）作出罚款、拘留、吊销驾驶证等处罚。
• 车辆处理：若车辆属于拼装或套牌，可能被没收并强制报废；若仅是VIN问题，可能需恢复原状后放行，但需提供合法证明。

3. 责任承担角度

• 车主责任：若车主明知车辆存在两个VIN仍购买或使用，需承担主要法律责任。
• 驾驶人责任：若驾驶人不知情（如受雇驾驶），可能减轻或免除责任，但需提供证据证明。
• 其他责任人：若涉及销售、改装等环节，相关责任人也可能被追究法律责任。

4. 建议措施

• 配合调查：车主或驾驶人应积极配合交警调查，提供车辆合法来源证明（如购车发票、合格证等）。
• 咨询专业意见：因涉及法律定性及处罚，建议及时咨询律师，评估风险并制定应对策略。
• 整改车辆：若车辆VIN问题可整改（如恢复原状），需在交警指导下完成整改并申请放行。

提示：车辆识别代号问题涉及道路交通安全和车辆管理法规，处理不当可能面临严重法律后果。如有进一步疑问或需具体法律帮助，可直接向我咨询。