针对使用恐吓、威胁手段胁迫签订非法协议强占宅基地的行为，可按照以下步骤处理：

1. 立即固定证据
   需第一时间收集胁迫行为的证据，包括但不限于：

   • 录音、录像（如威胁时的对话、现场情况）；
     
   • 书面威胁材料（如恐吓信、短信、微信记录）；
     
   • 证人证言（目击者、知情人的书面或录音证言）；
     
   • 医疗记录（若胁迫导致人身伤害，需保留就诊记录）；
     
   • 非法协议原件（证明协议内容违法或非自愿签订）。
     证据的完整性直接影响后续维权效果，务必全面、客观地固定所有相关材料。

2. 向公安机关报案
   胁迫行为可能涉嫌《刑法》中的敲诈勒索罪或强迫交易罪：

   • 若以非法占有为目的，通过威胁手段强行索取财物（如宅基地使用权），可能构成敲诈勒索罪；
     
   • 若以暴力、威胁手段强迫他人签订协议，情节严重的，可能构成强迫交易罪。
     公安机关立案后，会依法调查取证，追究行为人刑事责任，同时可要求返还宅基地。

3. 向法院提起民事诉讼

   • 确认协议无效：根据《民法典》第150条，受胁迫签订的协议可请求法院撤销或确认无效。需在胁迫行为终止之日起1年内提起诉讼；
     
   • 返还宅基地：协议被确认无效后，可要求对方返还宅基地使用权，并恢复原状；
     
   • 赔偿损失：若因胁迫行为导致财产损失（如宅基地被占用期间的收益损失），可要求行为人赔偿。
     诉讼过程中需提交证据证明胁迫事实及协议违法性，法院将根据事实和法律作出判决。

4. 申请行政干预

   • 若宅基地涉及农村集体土地，可向当地自然资源部门或农业农村部门举报，要求查处非法占用土地行为；
     
   • 相关部门可依法责令行为人退还土地，并可能对其处以罚款或行政处罚。
     

注意事项：

• 宅基地使用权受法律严格保护，任何非法侵占行为均违法；
  
• 维权过程中需保持冷静，避免与行为人发生直接冲突，防止事态升级；
  
• 若行为人继续实施侵害（如强行占用、破坏宅基地），可向法院申请行为保全，要求其立即停止侵害。
  

建议：尽快携带所有证据材料，联系我进一步分析具体案情，制定针对性维权方案。