若两次嫖娼行为中仅一次被公安机关查获，将主要针对被查获的这一次违法行为进行处罚，但未被查获的那次若后续被发现仍可能被追责。具体分析如下：

1. 针对被查获的嫖娼行为：

   • 根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第六十六条第一款的规定，卖淫、嫖娼的，处十日以上十五日以下拘留，可以并处五千元以下罚款；情节较轻的，处五日以下拘留或者五百元以下罚款。
   • 公安机关在查获嫖娼行为后，会依法进行调查取证，包括询问当事人、收集相关证据等。
   • 若证据确凿，公安机关将根据违法情节的轻重，对违法行为人作出相应的行政处罚决定，如拘留、罚款等。

2. 针对未被查获的嫖娼行为：

   • 虽然该次行为未被公安机关当场查获，但并不意味着可以逃避法律责任。
   • 如果后续公安机关通过其他途径（如群众举报、其他案件牵连等）发现该次违法行为，且证据确凿，仍然可以依法对违法行为人进行处罚。
   • 需要注意的是，由于该次行为未被及时查获，可能在证据收集上存在一定困难，但并不影响公安机关依法追责的决心和可能性。

3. 其他注意事项：

   • 嫖娼行为不仅违反了治安管理处罚法，还违背了社会公德和道德规范，对个人形象和社会风气造成不良影响。
   • 公安机关在打击卖淫嫖娼等违法犯罪行为时，会依法保护公民的合法权益，同时也会对违法行为人进行严厉的惩处。
   • 作为公民，应当自觉遵守法律法规，远离任何违法犯罪行为，共同维护社会的和谐稳定。

建议：

• 如果您或您身边的人涉及此类问题，应主动配合公安机关的调查工作，如实陈述事实，争取从轻或减轻处罚。
• 同时，也要认识到嫖娼行为的违法性和危害性，自觉遵守法律法规，树立正确的价值观和道德观。

温馨提醒：在日常生活中，我们应当增强法律意识，自觉遵守各项法律法规，共同营造一个和谐、稳定、法治的社会环境。如果您还有其他法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。