结论：针对您网贷已还清却仍被电话短信恶意催收的情况，您可以通过保留证据、与催收方沟通、向相关机构投诉以及寻求法律帮助等途径来维护自己的合法权益。
详细分析与建议：
保留证据：
- 首先，您需要保留所有与催收相关的证据，包括电话录音、短信截图、邮件等。这些证据将有助于您后续维权时证明自己的清白和催收方的违法行为。
与催收方沟通：
- 在保留好证据后，您可以尝试与催收方进行沟通，明确告知他们您已经还清了网贷，并要求他们停止恶意催收行为。在沟通过程中，保持冷静和理性，避免与催收方发生冲突。
向相关机构投诉：
- 如果与催收方的沟通无果，您可以向相关机构进行投诉。具体来说，您可以：
- 向当地银保监会（或金融监管局）投诉，反映催收方的违法行为，要求他们进行调查和处理。
- 向互联网金融协会等自律组织投诉，这些组织通常会对会员单位的违规行为进行调查和处罚。
- 如果催收方涉及暴力、威胁等违法行为，您还可以向公安机关报案，要求他们依法处理。
寻求法律帮助：
- 如果上述途径均无法解决问题，您可以考虑寻求法律帮助。具体来说，您可以：
- 咨询专业律师，了解您的法律权益和维权途径。律师可以根据您的具体情况，为您提供个性化的法律建议。
- 如果催收方的行为已经构成了侵权或犯罪，您可以考虑向法院提起诉讼或向公安机关报案，要求催收方承担相应的法律责任。
法律背景：
- 根据《中华人民共和国治安管理处罚法》等相关法律法规，恶意催收、骚扰他人等行为可能构成违法行为，会受到相应的行政处罚。
- 如果催收方使用暴力、威胁等手段进行催收，还可能构成犯罪，如寻衅滋事罪、敲诈勒索罪等，将受到刑事处罚。
后续行动建议：
- 在处理此类问题时，请务必保持冷静和理性，避免与催收方发生不必要的冲突。
- 及时保留和整理相关证据，以便在后续维权过程中使用。
- 如果您对法律程序不熟悉或感到困惑，建议及时咨询专业律师以获取帮助。
如果您在处理此类问题时遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供个性化的法律建议。