是的，聚众扰乱秩序罪（通常指聚众扰乱社会秩序罪）的案件处理必须经过检察院。以下从几个方面为你详细解释：
刑事诉讼流程的基本要求： 在我国的刑事诉讼体系中，任何刑事案件的处理都需要遵循法定的程序。聚众扰乱社会秩序罪作为刑事案件的一种，也不例外。一般来说，案件会先由公安机关进行侦查，收集证据，查明犯罪事实。侦查终结后，公安机关会将案件移送至检察院进行审查起诉。检察院在审查过程中，会对案件的事实、证据、法律适用等进行全面审查，决定是否对犯罪嫌疑人提起公诉。
检察院的审查起诉职能： 检察院作为国家的法律监督机关，在刑事诉讼中承担着审查起诉的重要职责。对于公安机关移送的聚众扰乱社会秩序罪案件，检察院会依法进行审查，包括审查案件事实是否清楚、证据是否确实充分、犯罪嫌疑人是否应当承担刑事责任等。如果检察院认为案件符合起诉条件，就会向法院提起公诉，由法院进行审判。
法律程序的必要性： 经过检察院的审查起诉程序，可以确保案件的公正处理。检察院的审查不仅是对公安机关侦查工作的监督，也是对犯罪嫌疑人合法权益的保障。通过检察院的审查，可以避免冤假错案的发生，确保法律的正确实施。
特殊情况下的处理： 当然，也存在一些特殊情况。例如，如果公安机关认为案件情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪，或者犯罪嫌疑人已经死亡等，那么公安机关可能会撤销案件，而不再移送检察院审查起诉。但这种情况并不改变聚众扰乱秩序罪案件原则上必须经过检察院审查起诉的基本流程。
总结来说，聚众扰乱秩序罪的案件处理必须经过检察院的审查起诉程序，这是我国刑事诉讼流程的基本要求，也是确保案件公正处理、保障犯罪嫌疑人合法权益的重要环节。如果你或你身边的人涉及此类案件，有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。