企业主体变更时，软件著作权确实需要进行相应的变更登记。这一结论主要基于以下几点法律背景和实际操作考虑：

一、法律背景

根据《计算机软件保护条例》及《中华人民共和国著作权法》的相关规定，软件著作权人可以依法转让其著作权，并获取相应报酬。当企业主体发生变更，如企业名称变更、企业合并、分立或注销后由新企业继承等情形，软件著作权的归属也可能随之发生变化。为了确保软件著作权的合法性和有效性，以及维护相关权利人的合法权益，进行软件著作权的变更登记是必要的。

二、变更流程与所需材料

1. 达成变更协议：

   • 企业主体变更后，新旧著作权人（或相关权利人）应就软件著作权的变更事宜协商一致，并签订书面变更协议或转让合同。合同中应明确变更事项、权利范围、变更价格（如有）、付款方式、违约责任等条款。

2. 准备申请材料：

   • 《计算机软件著作权登记申请表》：在线填写并打印，详细准确地填写变更前后著作权人的相关信息。
   • 申请人身份证明文件：提供新旧著作权人的身份证明文件，如企业营业执照副本复印件（加盖公章）、自然人身份证复印件等。
   • 原软件著作权登记证书复印件：作为原有著作权归属的证明。
   • 变更证明文件：如企业名称变更核准通知书、企业合并或分立的证明文件、继承证明文件等，根据变更类型提供相应的证明材料。
   • 著作权转让合同（如适用）：如果软件著作权是通过转让方式变更的，需提供转让合同原件。

3. 提交申请：

   • 向中国版权保护中心或通过其线上平台提交申请材料。

4. 审查与公告：

   • 中国版权保护中心对申请进行审查，通常自受理日起60日内完成。审查通过后，予以登记，并发给新的登记证书，同时在官方渠道公告变更信息。

三、注意事项与风险提示

1. 及时变更登记：虽然变更协议或转让合同生效即发生权利转移，但登记变更具有公示效力，可以对抗第三人，保护受让方或新著作权人的权益。因此，建议尽快办理变更登记手续。

2. 权利范围明确：在变更协议或转让合同中，务必清晰界定变更或转让的权利范围，避免未来因权利范围不明确而引发纠纷。

3. 合同形式要求：变更协议或转让合同必须采用书面形式，并由双方签字（或盖章）确认，以确保其法律效力。

4. 真实性与有效性：所有提交的文件必须真实有效，任何虚假信息都可能导致申请被拒或引发法律责任。

四、实际操作建议

• 在进行企业主体变更前，建议先对软件著作权进行梳理和评估，明确哪些软件著作权需要进行变更登记。
• 在办理变更登记过程中，如遇到任何疑问或困难，可以随时向我咨询，我会提供专业的法律指导和帮助。

综上所述，企业主体变更时，软件著作权确实需要进行相应的变更登记。这不仅是为了符合法律法规的要求，也是为了保护相关权利人的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。