企业善意取得的赃物，在一般情况下是可以被扣押的，但存在特殊情形。以下从不同角度为你详细分析：
法律原则与规定
赃物的性质：赃物，顾名思义，是指通过非法手段获取的财物。在法律上，赃物并不因其后续流转而改变其非法性质。无论赃物经过多少手流转，其原始非法性始终存在，这是法律对赃物处理的基本原则。
善意取得制度：善意取得是指无权处分人将其受托占有的他人的财物转让给第三人的，如受让人在取得该财物时系出于善意，则受让人取得该物的所有权，原权利人丧失所有权。然而，善意取得制度并不适用于赃物。这是因为赃物的非法性决定了其不能成为合法交易的对象，无论受让人是否善意，都不能改变赃物的非法性质。
扣押的法律依据：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》等相关法律规定，公安机关、人民检察院等执法机关在侦查犯罪过程中，有权对与犯罪有关的财物进行扣押。这包括赃物以及可能用于证明犯罪嫌疑人有罪或者无罪的各种物品和文件。因此，即使企业善意取得了赃物，执法机关仍有权依法进行扣押。
特殊情形与考量
企业不知情且支付合理对价：如果企业在取得赃物时确实不知情，并且支付了合理的对价，那么企业在法律上可能享有一定的权益保护。然而，这种保护并不意味着赃物不能被扣押。执法机关在扣押赃物后，会依法进行调查和处理。如果企业确实无过错，且赃物的扣押对其造成了损失，企业可以通过法律途径寻求赔偿。
赃物与合法财物的混同：在某些情况下，赃物可能与企业的合法财物混同在一起，难以区分。在这种情况下，执法机关在扣押时需要谨慎处理，避免对企业的合法财物造成不必要的损失。企业可以积极配合执法机关的调查，提供相关证据和资料，以证明赃物与合法财物的区分。
法律建议与风险提示
加强内部管理：企业应加强内部管理，建立完善的财物管理制度和审批流程，确保在取得财物时能够充分了解其来源和性质，避免善意取得赃物的风险。
积极配合执法机关：如果企业的财物被执法机关扣押，企业应积极配合执法机关的调查和处理工作，提供相关证据和资料，以证明自身的清白和合法权益。
寻求法律帮助：如果企业对扣押决定有异议或认为自身的合法权益受到了侵害，可以及时向我咨询，我会根据具体情况为你提供专业的法律建议和帮助。
总结来说，企业善意取得的赃物在一般情况下是可以被扣押的。但企业在面对这种情况时，应积极配合执法机关的调查和处理工作，并寻求专业的法律帮助以维护自身的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。