针对您提出的“离职证书在单位注册了怎么办”的问题，这通常涉及到的是职业资格证书或执业注册证书在离职后单位未及时注销或办理相关变更手续的情况。以下我将根据不同职业类型，为您提供详细的解答和建议：
一、对于注册建造师等工程类职业
根据《注册建造师执业管理办法》的相关规定，如果您已与原聘用企业解除劳动关系，但企业仍不予配合办理建造师相关手续（包括注销注册），您可以采取以下措施：
准备材料：
- 提交申请报告，注明您的注册经历、与企业的纠纷情况，并在报告落款处亲笔签字并按手印。
- 提供与原聘用企业解除劳动关系的有效证明材料原件和复印件。
申诉途径：
- 将上述材料提交至省注册中心注册科进行申诉。您需要查找并确认您所在省份的注册中心地址和联系方式（例如，参考信息中提到的福建省的地址和联系电话）。
后续跟进：
- 提交申诉后，保持与注册中心的沟通，及时了解处理进度和结果。
二、对于医师等医疗类职业
对于医师执业注册（离职备案）的情况，根据《医师执业注册管理办法》的规定：
离职备案要求：
- 医师在调离、退休、退职、被辞退、开除等情况下，其所在的医疗、预防、保健机构应当自办理相关手续之日起30日内报注册主管部门，办理备案。
备案材料：
- 通常需要提供医师离职备案报告表等材料，具体要求和格式可能因地区而异，建议您咨询当地卫生计生行政部门或注册主管部门。
特殊情况处理：
- 如果医师因外出学习等原因暂时不在医疗机构，可以先办理离职备案。
- 如果备案满2年且未继续执业，相关证书可能会被注销。
申请方式：
- 您可以根据个人情况选择窗口领取、代领或邮寄等方式获取办理结果。
- 如果需要邮寄材料，应说明邮递地址、邮递接收人、接收人电话等信息。
三、通用建议
沟通协商：
- 在采取任何法律或行政手段之前，首先尝试与原单位进行沟通协商，看是否能够达成一致并解决问题。
了解政策：
- 详细了解您所在职业的相关政策法规，确保自己的权益得到保障。
寻求帮助：
- 如果沟通协商无果，您可以咨询当地劳动监察部门、行业协会或法律援助机构等，寻求专业的帮助和建议。
保留证据：
- 在整个过程中，务必保留好所有相关的证据材料，如离职证明、解除劳动关系协议、沟通记录等，以备不时之需。
希望以上解答和建议能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。