当您在工程公示期发现有异议时，可以按照以下步骤来处理，以确保您的权益得到妥善维护：
一、详细研读相关文件与法规
首先，您需要仔细阅读招标公告、招标文件以及《中华人民共和国招标投标法》、《中华人民共和国招标投标法实施条例》等相关法律法规。这些文件和法规是提出异议的前提和基础，它们详细规定了招投标活动的流程、规定、权利和义务，以及提出异议的具体要求、时间期限和法定程序。
二、及时且规范地提出异议
时间要求：根据相关法律法规，您应在中标候选人公示期间（通常这个期限不少于3日）内提出异议。这是确保您的异议能够被及时受理和处理的关键。
形式与内容：异议应以书面形式提出，并确保内容明确、详细。异议书应包括您的基本信息、被异议人的名称、异议事项的基本事实、相关请求及主张，以及有效线索和相关证明材料等。这些信息将帮助招标方或相关机构更好地理解您的异议，并作出合理的答复。
提交对象：按照招标文件的规定，您应将异议书提交给招标人或招标代理机构。如果必要，您还可以同时抄送有关行政监督部门，以确保您的异议得到更广泛的关注和处理。
三、积极跟进异议处理进展
处理期限：招标人应在收到您的异议之日起3日内作出答复，并暂停招标投标活动直至答复完毕。这是法律规定的处理期限，招标方必须遵守。
沟通渠道：在等待答复的过程中，您应保持与招标方或相关机构的沟通渠道畅通。这有助于您及时了解异议的处理进展和结果，并在必要时提供进一步的证据或信息。
四、对处理结果不满的后续措施
投诉条件：如果您对招标人的答复不满意，或者招标人未在规定时间内答复，您可以在知道或应当知道权益受到侵害之日起十日内向有关行政监督部门提出投诉。这是维护您权益的另一种重要途径。
投诉内容与形式：投诉时，您应提供明确的请求和必要的证明材料。投诉通常应以书面形式提交，以确保信息的准确性和完整性。
投诉处理：行政监督部门将对您的投诉事项进行调查处理，并在规定时间内作出决定。这可能包括责令招标人改正违法行为、对违规单位和个人进行行政处罚等。
五、寻求专业法律支持
在整个过程中，如果您感到困惑或不确定如何操作，咨询专业的法律顾问或律师是至关重要的。他们可以确保您的异议的合理性、合法性，并提供具体的法律建议和支持。这将有助于您更好地保护自身合法权益，提高异议处理的专业性和有效性。
综上所述，处理工程公示期的异议是一个严谨而复杂的过程。您需要充分了解相关法律法规和招标文件要求，遵循规定的程序和时间节点进行操作，并积极跟进处理进展。在必要时，寻求专业法律支持是保障自身权益的有效途径。