若您因渔业违法行为被渔政部门查处已两个月，当前应尽快主动联系渔政部门确认案件处理进度，并配合完成后续程序。具体分析如下：

1. 案件处理流程的时效性
   根据《行政处罚法》第六十条，行政机关一般应在立案之日起90日内作出行政处罚决定（特殊情况经批准可延长）。您被查处两个月（约60日），案件可能处于调查取证、告知权利或听证阶段，也可能已进入处罚决定阶段但未送达。主动联系渔政部门（如电话、书面函件）是明确案件状态的关键，避免因信息滞后导致程序延误。

2. 可能面临的法律后果

   • 行政处罚类型：渔业违法行为通常涉及罚款、没收渔具/渔获物、吊销许可证等。例如，非法捕捞水产品可能按《渔业法》第三十八条处5万元以下罚款；情节严重（如使用禁用工具、在禁渔区捕捞）可能构成犯罪（《刑法》第三百四十条），需承担刑事责任。
     
   • 处罚决定送达：若渔政部门已作出处罚决定，您需在收到决定书后15日内履行（如缴纳罚款），逾期可能产生滞纳金或被强制执行。若对处罚有异议，应在60日内申请行政复议或6个月内提起行政诉讼，但需以收到决定书为前提。

3. 您的权利与义务

   • 陈述申辩权：在渔政部门告知拟处罚内容后，您有权在3-7日内提出书面或口头陈述、申辩，提交证据（如误捕、紧急避险等免责事由）。
     
   • 听证权：若处罚涉及较大数额罚款（如个人5000元以上、单位5万元以上）、吊销许可证等，您可要求举行听证，渔政部门应在收到申请后20日内组织。
     
   • 配合义务：若案件需进一步调查（如渔获物鉴定、证人询问），您需配合提供材料或接受询问，否则可能被认定为“拒不配合调查”，加重处罚。

4. 建议行动步骤

   • 第一步：联系渔政部门：携带身份证、查处时的相关文书（如现场检查笔录、扣押清单）到渔政办公室，或通过电话/邮件询问案件编号、承办人、当前阶段。
     
   • 第二步：核对处罚依据：要求渔政部门出示处罚依据的法律法规条款（如《渔业法》第三十八条），确认违法事实是否准确（如捕捞时间、地点、工具是否与实际情况一致）。
     
   • 第三步：准备申辩材料：若认为处罚过重或事实有误，收集证据（如渔船GPS轨迹、证人证言、许可证复印件）并撰写书面申辩意见，在规定期限内提交。
     
   • 第四步：履行或救济：若认可处罚，按决定书要求履行；若不认可，及时申请复议或诉讼，避免超过期限丧失权利。

提示：渔业违法案件常涉及技术性证据（如渔获物种类、捕捞工具规格），若对渔政部门的鉴定结论有疑问，可申请重新鉴定或委托第三方机构出具意见，作为申辩或诉讼的依据。如有具体案件细节（如查处地点、违法情节），可进一步向我说明，我会结合地方性法规提供更精准的建议。