结论：股东违反章程规定转让股份，在特定条件下可以适用善意取得制度，但并非绝对，需根据具体情况综合判断。

分析说明：

1. 善意取得制度的基本原理：

   • 善意取得，是指无权处分人将其受托占有的他人的财物转让给第三人的，如受让人在取得该财物时系出于善意，则受让人取得该物的所有权，原权利人丧失所有权。
   • 在公司法领域，这一制度同样可以适用，但需满足一定的条件，包括受让人受让该财产时是善意的、以合理的价格有偿转让、转让的财产依照法律规定应当登记的已经登记，不需要登记的已经交付给受让人。

2. 股东违反章程规定转让股份的情形：

   • 公司章程是公司内部的“宪法”，对股东具有约束力。股东在转让股份时，应遵守公司章程的规定。
   • 若股东违反章程规定转让股份，如未经其他股东同意、未满足优先购买权等，则可能构成无权处分。

3. 善意取得在股东违反章程规定转让股份中的适用：

   • 适用条件：若受让人在受让股份时是善意的（即不知且不应知转让方无权处分）、以合理的价格有偿受让、且股份已经依法登记或交付，则可能构成善意取得。
   • 不适用情形：若受让人明知或应知转让方无权处分股份，或未以合理价格受让，或股份未依法登记或交付，则不构成善意取得。
   • 公司章程的特别规定：如果公司章程对股份转让有特别限制，且这些限制不违反法律法规的强制性规定，那么这些限制可能构成对善意取得制度的适用障碍。例如，如果章程明确规定股份转让需经全体股东同意，而受让人在明知或应知这一规定的情况下仍受让股份，则可能不被认定为善意取得。

4. 法律后果：

   • 若构成善意取得，受让人取得股份的所有权，原股东丧失所有权，且可能需承担违约责任或赔偿责任。
   • 若不构成善意取得，受让人不能取得股份的所有权，原股东有权追回股份，并可能要求受让人承担侵权责任或不当得利返还责任。

法律建议：

• 对于股东而言，在转让股份时应严格遵守公司章程的规定，避免构成无权处分。
• 对于受让人而言，在受让股份前应充分了解公司章程的规定，确保受让行为的合法性，并尽可能要求转让方提供相关的证明文件。
• 若发生股东违反章程规定转让股份的情况，建议及时咨询专业律师，以便根据具体情况采取合适的法律措施。

进一步思考：

• 在实践中，善意取得制度的适用往往涉及复杂的法律判断和事实认定，因此需要综合考虑多种因素。
• 公司章程的制定和修改应充分考虑股份转让的灵活性和安全性，以平衡股东之间的利益。
• 随着公司法理论的不断发展，善意取得制度在公司法领域的适用也可能会有所变化，因此需要持续关注相关的法律动态和司法实践。

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