针对申请人申请许可时提交虚假材料的情况，处理方式主要依据相关法律法规进行，以下为您详细阐述：

一、一般情况下的处理

根据《中华人民共和国行政许可法》第七十八条的规定，如果行政许可申请人在申请过程中隐瞒了有关情况或者提供了虚假材料，行政机关将不予受理其申请或者不予行政许可，并会给予警告。这一规定旨在维护行政许可的公正性和严肃性，防止申请人通过不正当手段获取许可。

二、涉及公共安全等特殊事项的处理

如果行政许可申请直接关系到公共安全、人身健康、生命财产安全等重要事项，那么对于提供虚假材料的申请人，除了上述不予受理或不予行政许可、给予警告的处理外，还将在一年内禁止其再次申请该行政许可。这一更严厉的措施是为了确保这些关键领域的许可申请得到严格把关，防止潜在的安全风险。

三、已取得行政许可后的处理

如果申请人在提交虚假材料后已经取得了行政许可，但后续被发现存在隐瞒或虚假情况，行政机关将依法撤销该行政许可，并对其进行相应的处理。这可能包括罚款、没收违法所得、责令停产停业等行政处罚，甚至可能构成犯罪，需要依法追究刑事责任。

四、具体行业或地区的特殊规定

除了上述一般性的法律规定外，不同行业或地区可能还有针对提交虚假材料申请行政许可的特殊规定。例如，在药品、医疗器械等关键领域，相关监管部门可能会发布更具体的公告或规定，明确对提交虚假材料申请人的处理措施。这些特殊规定通常更加严格，旨在确保这些领域的市场秩序和公共安全。

五、建议与提醒

对于申请人而言，诚实守信是申请行政许可的基本原则。提交虚假材料不仅可能导致申请被拒绝或撤销，还可能面临法律处罚和声誉损失。因此，建议申请人在准备申请材料时务必真实、准确、完整，积极配合行政机关的核查和检查工作。

综上所述，对于申请人申请许可时提交虚假材料的情况，行政机关将依法进行严肃处理，以维护行政许可的公正性和严肃性。希望以上解答能对您有所帮助。