辞职后被扣工资是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度为你详细分析：
一、合法扣减工资的情形
法定扣减：
- 个人所得税：根据《中华人民共和国个人所得税法》，用人单位作为扣缴义务人，需依法代扣代缴劳动者的个人所得税。这部分扣减是合法的，且劳动者最终实际到手的工资是税后工资。
- 社会保险费用：用人单位和劳动者需共同缴纳社会保险费用，包括养老保险、医疗保险、失业保险等。用人单位有权从劳动者工资中代扣代缴劳动者应承担的部分。
- 法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费：若劳动者有法院判决或裁定要求支付抚养费、赡养费等，用人单位也有权根据判决或裁定从劳动者工资中代扣。
- 法律法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用：如劳动者因个人原因给用人单位造成经济损失，且用人单位有明确规章制度规定可从工资中扣除赔偿的，用人单位可依法扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
约定扣减（需合法合理）：
- 若用人单位与劳动者在劳动合同或规章制度中明确约定了某些情况下可以扣减工资，且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位在符合约定条件的情况下扣减工资是合法的。例如，约定劳动者迟到、早退需扣减相应工资，且扣减标准合理。
二、非法扣减工资的情形
无合法依据扣减：
- 若用人单位无法提供合法依据，如无法证明劳动者存在违反规章制度的行为，或规章制度本身不合法、不合理，却擅自扣减劳动者工资，这种行为是违法的。
扣减工资超过法定或约定限度：
- 即使存在合法扣减工资的情形，如扣减社会保险费用、个人所得税等，用人单位也不得超过法定或约定的限度。例如，每月扣除劳动者工资的比例不得超过20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。若用人单位超过这些限度扣减工资，则构成违法。
以非法目的扣减工资：
- 若用人单位以报复、威胁等非法目的扣减劳动者工资，这种行为显然是违法的，且可能构成对劳动者权益的严重侵害。
三、劳动者应对措施
与用人单位协商：
- 若劳动者发现用人单位存在非法扣减工资的行为，首先可以尝试与用人单位协商，要求用人单位说明扣减工资的原因，并提供合法依据。若用人单位无法提供合法依据或拒绝说明原因，劳动者可以进一步采取其他措施。
向劳动监察部门投诉：
- 劳动者可以向当地劳动监察部门投诉用人单位的非法扣减工资行为。劳动监察部门有权对用人单位进行调查，并要求用人单位改正违法行为，支付被扣减的工资及可能的赔偿金。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 若劳动者与用人单位无法通过协商或投诉解决争议，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，或直接向人民法院提起诉讼。在仲裁或诉讼过程中，劳动者需提供相关证据证明用人单位存在非法扣减工资的行为，以维护自己的合法权益。
温馨提示：若你遇到辞职后被扣工资的情况，建议先与用人单位沟通，了解扣减工资的具体原因和依据。若认为用人单位的行为违法，可及时收集相关证据，如工资条、劳动合同、规章制度等，以便在后续维权过程中使用。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。