若车身颜色未依法进行变更登记，根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关实施条例，主要处罚措施为罚款，具体金额及处理流程需结合地方性法规确定。以下从法律责任、处理流程、特殊情形三个角度展开说明：

1. 法律责任：罚款为主，无扣分或拘留

根据《机动车登记规定》（公安部令第164号）第十六条，改变车身颜色需在变更后10日内向车辆管理所申请变更登记。若未按时办理，依据《道路交通安全法》第九十条，公安机关交通管理部门可处警告或20元以上200元以下罚款。
关键点：

• 罚款幅度由地方性法规细化（如北京、上海等地通常罚款200元）；
  
• 仅违反登记程序，不涉及扣分或行政拘留；
  
• 若同时存在其他违法行为（如非法改装、使用伪造证件），可能叠加处罚。

2. 处理流程：补办登记可免后续处罚

若被查处后及时补办变更登记，通常不会进一步处罚，但需按以下步骤操作：

1. 准备材料：身份证、行驶证、机动车登记证书、车辆照片（显示新颜色）；
   
2. 前往车管所：填写《机动车变更登记申请表》，交验车辆；
   
3. 更换行驶证：车管所核发新行驶证后，原处罚记录可消除。
   提示：部分城市支持线上预约办理（如通过“交管12123”APP），可缩短现场等待时间。

3. 特殊情形：营运车辆或改装限制

• 营运车辆：若车身颜色为营运标识（如出租车黄色、网约车专属色），未变更登记可能影响营运资质，需同步向交通主管部门报备；
  
• 改装限制：若颜色变更涉及非法改装（如改变车辆结构、动力系统），除罚款外，可能被责令恢复原状，甚至扣留车辆。

建议：若您已变更车身颜色但未登记，请尽快补办手续；若对处罚有异议，可申请行政复议或提起行政诉讼。如有其他细节需进一步分析（如地方性法规差异、是否涉及其他违法行为），可直接向我咨询。