结论：在嫖娼案件中，如果证据链存在瑕疵，且只有笔录作为证据，是否会被处罚取决于多种因素，包括笔录的内容、其他可能存在的间接证据以及案件的具体情况。一般来说，仅有笔录作为单一证据，且证据链存在明显瑕疵时，可能不足以对行为人进行处罚，但并非绝对。以下是对此问题的详细分析：
一、法律对嫖娼行为的处罚规定
根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第六十六条的规定，卖淫、嫖娼的，处十日以上十五日以下拘留，可以并处五千元以下罚款；情节较轻的，处五日以下拘留或者五百元以下罚款。这一规定明确了嫖娼行为的法律后果，但同时也要求有充分的证据来证明行为人的违法事实。
二、证据链的重要性及瑕疵的影响
证据链的重要性：
- 在刑事案件或行政处罚案件中，证据链的完整性和可靠性是认定案件事实的关键。证据链需要包含多个相互印证、能够形成完整证明体系的证据，以确保案件事实的准确认定。
瑕疵对证据链的影响：
- 如果证据链存在瑕疵，如证据收集程序不合法、证据内容不真实或存在矛盾等，都可能影响证据的证明力。在嫖娼案件中，如果只有笔录作为证据，且笔录的内容存在疑点或与其他证据无法相互印证，那么证据链就可能被视为存在瑕疵。
三、仅有笔录作为证据时的处罚可能性
笔录的内容和质量：
- 如果笔录内容详细、真实，且能够与其他间接证据（如交易记录、通讯记录等）相互印证，形成完整的证据链，那么即使证据链存在一定瑕疵，也可能对行为人进行处罚。
- 如果笔录内容模糊、存在矛盾，或者无法与其他证据相互印证，那么仅凭笔录作为单一证据，可能不足以对行为人进行处罚。
其他间接证据的存在：
- 在嫖娼案件中，除了笔录外，还可能存在其他间接证据，如交易记录、通讯记录、监控录像等。这些证据虽然不能直接证明行为人的违法事实，但可以与笔录相互印证，增强证据的证明力。
- 如果存在其他间接证据，且这些证据与笔录相互印证，形成完整的证据链，那么即使笔录本身存在一定瑕疵，也可能对行为人进行处罚。
案件的具体情况：
- 案件的具体情况也是影响处罚可能性的重要因素。例如，如果行为人承认了自己的违法事实，或者有其他目击证人能够证明行为人的违法事实，那么即使证据链存在瑕疵，也可能对行为人进行处罚。
- 相反，如果行为人否认自己的违法事实，且没有其他直接或间接证据能够证明其违法事实，那么仅凭笔录作为单一证据，可能不足以对行为人进行处罚。
四、法律建议
保留相关证据：
- 如果您或您身边的人涉及嫖娼案件，建议尽可能保留与案件相关的所有证据，包括笔录、交易记录、通讯记录等。这些证据可能对案件的认定和处罚产生重要影响。
寻求法律帮助：
- 如果您对案件的处理结果存在疑虑或不满，建议及时寻求法律帮助。作为专业律师，我可以根据您的具体情况提供法律咨询和辩护服务，帮助您维护自己的合法权益。
遵守法律法规：
- 无论案件的处理结果如何，都建议您遵守国家的法律法规，不再从事任何违法活动。遵守法律法规是每个公民的责任和义务，也是维护社会和谐稳定的重要保障。
最后，需要强调的是，每个案件的具体情况都是独特的，因此无法一概而论地判断仅有笔录作为证据时是否会被处罚。如果您或您身边的人涉及此类案件，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更准确的法律建议。