当遇到违章建筑出现拖欠工程款的情况时，处理起来确实需要一些策略和步骤。以下是我为您详细梳理的解决方案：

一、协商和解

适用情况：如果与发包方关系尚未破裂，且对方有还款意愿和能力，只是因某些临时原因（如资金周转暂时困难）导致拖欠，那么协商和解是一个不错的选择。

具体操作：

• 主动与发包方进行沟通，了解拖欠的具体原因。
• 提出合理的还款要求和期限，例如制定一个分阶段的还款计划，明确每个阶段的还款金额和时间节点。
• 在协商过程中，保持冷静和理性，以解决问题为目的，避免情绪化。

优势：成本较低、效率较高，能够维护双方的合作关系，避免矛盾进一步激化。

二、请求调解

适用情况：当双方自行协商无法达成一致意见时，可以寻求第三方的帮助进行调解。

具体操作：

• 向工程所在地的建设行政主管部门、行业协会或其他有关机构申请调解。
• 提供相关证据和资料，以便调解机构了解事情的全貌。
• 调解机构会根据双方提供的证据和相关法律法规，进行公正、客观的调解，促使双方达成和解协议。

优势：调解具有灵活性和专业性，能够在一定程度上缓解双方的矛盾，提高解决问题的效率。

三、申请仲裁（如果合同中有仲裁条款或双方达成仲裁协议）

适用情况：如果双方在合同中约定了仲裁条款，或者在纠纷发生后达成了仲裁协议，那么仲裁是一个有效的解决方式。

具体操作：

• 按照仲裁协议的约定，向选定的仲裁委员会提交仲裁申请书及相关证据材料。
• 仲裁委员会会组成仲裁庭，对案件进行审理并作出裁决。
• 裁决结果具有法律效力，双方必须履行。

优势：仲裁具有一裁终局的特点，能够快速有效地解决纠纷。同时，仲裁程序相对保密，有利于保护双方的商业秘密。

四、提起诉讼

适用情况：当协商、调解和仲裁都无法解决问题时，提起诉讼是最后的法律手段。

具体操作：

• 准备起诉状及相关证据材料，如施工合同、工程变更通知、验收报告、结算文件、付款凭证、催款记录等。
• 向被告住所地或合同履行地的人民法院提交立案申请。
• 法院受理后，会依法进行审理，并根据事实和法律作出判决。
• 如果对方不履行判决，可以申请强制执行。

优势：诉讼是一种最具强制力的解决方式，法院的判决具有最高的法律效力。

五、其他辅助措施

1. 保留证据：在整个过程中，务必注意收集和保留相关证据。这些证据将在后续的协商、调解、仲裁或诉讼中发挥重要作用。
2. 及时主张权利：要注意诉讼时效的规定，及时向对方主张权利。一般来说，民事权利的诉讼时效为三年，从知道或者应当知道权利被侵害时起计算。避免因超过诉讼时效而丧失胜诉权。

特别提醒

对于违章建筑，虽然其本身可能存在合法性问题，但这并不影响您作为承包方追讨工程款的权利。您仍然可以依据上述步骤来维护自己的合法权益。同时，如果可能的话，建议您在追讨工程款的同时，也关注违章建筑的处理情况，以免因建筑本身的违法性而给您带来不必要的麻烦。