若农村土地边界被占，可按以下步骤处理：

1. 确认土地权属与边界
   首先需明确土地权属是否清晰，包括土地承包经营权证、宅基地使用权证等权属证明文件是否完备。若权属存在争议（如未确权或登记错误），需先通过土地确权程序解决权属问题。若权属明确，需核对土地四至范围（东、南、西、北边界）是否与权属证书或土地承包合同记载一致，必要时可委托专业测绘机构出具边界测绘报告。

2. 协商解决
   在权属与边界明确的前提下，可优先与侵占方协商，要求其停止侵占、恢复原状或赔偿损失。协商过程中建议留存书面记录（如协议、录音、照片等），以固定证据。若侵占方为邻居或同村村民，可邀请村委会或基层调解组织介入调解，形成调解协议并申请司法确认以增强执行力。

3. 行政投诉
   若协商未果，可向当地自然资源部门（原国土资源局）或农业农村部门投诉，要求其履行土地监管职责，查处非法侵占行为。根据《土地管理法》第七十七条，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状。

4. 民事诉讼
   若行政投诉未解决或侵占行为已造成实际损失（如农作物毁损、土地无法耕种等），可向法院提起民事侵权诉讼，主张停止侵害、排除妨碍、返还土地或赔偿损失。诉讼中需提供权属证明、边界测绘报告、侵占现场照片、损失评估报告等证据。若侵占方构成恶意侵占，还可主张惩罚性赔偿。

5. 刑事报案（极端情况）
   若侵占行为涉及非法占用农用地罪（如将耕地改为建设用地且数量较大），可向公安机关报案。根据《刑法》第三百四十二条，违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。

注意事项：

• 土地纠纷处理需严格遵循“权属清晰→协商优先→行政介入→司法救济”的顺序，避免程序倒置导致维权成本增加。
  
• 农村土地边界争议常涉及历史遗留问题（如分田到户时的边界模糊），处理时需结合当地政策、村规民约及历史使用情况综合判断。
  
• 若土地已被征收为国有，则需通过行政复议或行政诉讼主张权利，而非民事途径。
  

如有进一步证据或具体情节，可提供详细信息以便针对性分析。