针对您提出的“土地登记程序违法违规怎么处理”的问题，这确实是一个涉及土地管理和法律责任的重要议题。以下是我为您详细梳理的处理流程和相关法律依据：
一、识别违法违规行为
首先，需要明确的是，土地登记程序的违法违规行为可能包括但不限于：无权批准征收、使用土地的单位或个人非法批准占用土地；超越批准权限非法批准占用土地；不按照土地利用总体规划确定的用途批准用地；或者违反法律规定的程序批准占用、征收土地等。
二、处理措施
批准文件无效：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》第七十九条，对于上述违法违规行为，其批准文件是无效的。这意味着，任何基于这些无效批准文件进行的土地登记或使用行为都是不合法的。
责任追究：
- 对非法批准征收、使用土地的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，应依法给予处分。这可能包括警告、记过、记大过、降级、撤职或开除等行政处分。
- 如果这些行为构成犯罪，如滥用职权、玩忽职守等，还应依法追究刑事责任。
土地收回与赔偿：
- 非法批准、使用的土地应当被收回。如果有关当事人拒不归还，将以非法占用土地论处。
- 如果非法批准征收、使用土地的行为对当事人造成了损失，依法应当承担赔偿责任。
具体处罚措施：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》第七十七条，对于未经批准或者采取欺骗手段骗取批准非法占用土地的行为，县级以上人民政府自然资源主管部门将责令退还非法占用的土地。
- 如果违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地，将限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，并恢复土地原状。
- 如果符合土地利用总体规划，将没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，并可以并处罚款。罚款额根据《中华人民共和国土地管理法实施条例》第五十七条第一款，为非法占用土地每平方米100元以上1000元以下。
三、建议行动
收集证据：
- 如果您发现土地登记程序存在违法违规行为，首先应收集相关证据，如批准文件、土地使用记录、现场照片等。
向相关部门举报：
- 将收集到的证据提交给县级以上人民政府自然资源主管部门或其他有权处理的部门，进行举报和投诉。
寻求法律援助：
- 如果您的权益受到侵害，可以考虑寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。
综上所述，土地登记程序的违法违规行为将受到法律的严厉制裁。如果您发现此类行为，应及时向相关部门举报，并寻求法律援助以维护自己的权益。希望这些信息能对您有所帮助。