结论：在淘宝上买的食品有问题，一般情况下不能直接要求商家停业整顿，但可以通过合法途径维护自身权益，并促使相关部门对商家进行监管和处理。
分析说明：
消费者权益保护：
- 根据《中华人民共和国消费者权益保护法》，消费者在购买商品时享有安全保障权、知情权、选择权等基本权利。如果购买的食品存在问题，如过期、变质、含有有害物质等，消费者有权要求商家进行赔偿，包括退货、换货、退款以及赔偿损失等。
停业整顿的适用性：
- 停业整顿通常是一种行政处罚措施，由相关行政部门（如市场监督管理局）对违反法律法规的商家进行。它不是消费者直接可以要求的权利，而是需要行政部门根据商家的违法情节和严重程度来决定是否采取。
- 消费者可以通过投诉、举报等方式向行政部门反映商家的问题，由行政部门进行调查处理。如果商家确实存在严重违法行为，行政部门有权依法对其进行停业整顿等处罚。
消费者可采取的行动：
- 与商家协商：首先尝试与商家沟通，说明问题并要求解决。如果商家愿意配合，可以达成和解协议。
- 投诉举报：如果商家拒绝解决或态度恶劣，消费者可以向淘宝平台投诉，同时也可以向当地的市场监督管理局或消费者协会进行投诉举报。
- 法律诉讼：如果问题严重且无法通过协商或投诉解决，消费者还可以考虑通过法律途径提起诉讼，要求商家承担法律责任。
商家可能面临的后果：
- 如果商家被证实存在违法行为，除了可能面临停业整顿外，还可能受到罚款、没收违法所得、吊销营业执照等行政处罚。
- 同时，商家还可能因侵犯消费者权益而承担民事赔偿责任，包括赔偿消费者的直接损失和可能的间接损失。
行动建议：
- 保留证据：在发现问题食品后，务必保留好相关证据，如购买记录、食品照片、医疗证明（如果因食用问题食品导致健康受损）等。
- 及时投诉：尽快向淘宝平台和相关行政部门投诉举报，以便及时启动调查处理程序。
- 寻求法律帮助：如果问题复杂或涉及金额较大，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。
后续思考：
- 消费者在购买食品时应提高警惕，选择信誉良好的商家和品牌。
- 商家应严格遵守相关法律法规，确保所售食品的质量和安全。
- 行政部门应加强对食品市场的监管力度，及时发现和处理违法行为，保障消费者的合法权益。