针对您提出的“绿灯过来中间红灯了直接通行了，会不会扣分罚款”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
结论前置：此种情况有可能被判定为越线停车或闯红灯，但具体是否会被扣分以及扣分的多少，需根据当地的交通法规和具体情况来判断。若您在红灯亮起时及时停车且未造成交通影响，通常不会被认定为闯红灯，但可能会因“不按规定行车或停车”而面临一定的记分处罚（如记1分，部分地区此前可能记2分）。在特殊情况下，您还可以提供相关证据进行申诉，有可能撤销该处罚。
详细解析：
越线停车的认定与处罚：
- 根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶机动车行经交叉路口不按规定行车或者停车的，一次记1分。这意味着，如果您的车辆在红灯亮起时前轮或整个车身越过停止线并停在停止线以外，即构成越线停车，将面临记分处罚。
- 不同地区对于交通违法行为的认定和处罚可能存在差异，但普遍遵循上述规定。因此，您需要了解并遵守当地的交通法规。
闯红灯的认定：
- 判断是否闯红灯通常需要三张照片来佐证：车辆前轮过停止线、车辆后轮过停止线和车辆到达对面路口。如果只有前轮过线并及时停车，没有继续行驶至对面路口，则通常不会被认定为闯红灯。
- 在您的情况下，如果您在绿灯时进入路口，红灯亮起后及时停车且未继续行驶，那么一般不构成闯红灯。
特殊情况下的处理：
- 如果您是因为前方有大型车辆遮挡视线导致未能及时看到红灯而越线停车，或者是有交通警察现场指挥而按照交警的指示行驶导致的越线停车，您可以提供相关证据（如行车记录仪视频、交警指挥记录等）进行申诉。经核实后，有可能撤销该处罚。
其他可能的处罚与责任：
- 即使不被认定为闯红灯或越线停车，您也可能因为“不按规定行驶”或“妨碍交通”等行为而受到警告、罚款等其他形式的处罚。这取决于您停车的位置是否影响了其他车辆的通行以及当地的交通法规。
- 如果因您的停车位置不当而引发交通事故，您还需承担相应的法律责任。
建议与提醒：
- 在驾驶过程中，请务必保持注意力集中，严格遵守交通规则，确保行车安全。特别是在接近路口时，要提前观察交通信号灯的变化，做好减速或停车的准备。
- 如果您不小心出现了类似情况，请及时向当地交警部门咨询相关政策和处理方式，以免产生不必要的麻烦和损失。
- 了解并掌握当地的交通法规和处罚标准，以便在遇到问题时能够迅速做出正确的应对。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。